92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4852 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  100 
 
 
285 aa  566  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  63.24 
 
 
275 aa  329  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  60.77 
 
 
295 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  58.33 
 
 
310 aa  293  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  52.54 
 
 
289 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0337  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 
290 aa  239  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  55.61 
 
 
264 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
279 aa  224  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0331  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 
368 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  52.07 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  52.26 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0284  NUDIX hydrolase  53.92 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.144667 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5313  NUDIX hydrolase  46.47 
 
 
297 aa  212  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.723255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  47.55 
 
 
315 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0328  NUDIX hydrolase  51.34 
 
 
297 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121747  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  50.19 
 
 
272 aa  203  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  50.21 
 
 
247 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2088  NUDIX hydrolase  49.38 
 
 
277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13056  hypothetical protein  48.76 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1904  NUDIX hydrolase  47.84 
 
 
275 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269642  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1838  NUDIX hydrolase  47.84 
 
 
275 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181353  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1857  NUDIX hydrolase  47.84 
 
 
275 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1855  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 
278 aa  172  7.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22420  NUDIX family protein  40.16 
 
 
313 aa  159  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3177  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
303 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.334234 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  42.5 
 
 
290 aa  147  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3396  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  39.6 
 
 
550 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
545 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
273 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 
544 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  36.99 
 
 
556 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
264 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 
557 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02770  NUDIX family protein  37.56 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  33.87 
 
 
556 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0114  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
215 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0755049  normal  0.156914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  34.87 
 
 
562 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 
559 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 
568 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  33.2 
 
 
568 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  36.74 
 
 
267 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
264 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
260 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18290  putative hydrolase, NUDIX family domain protein  38.12 
 
 
300 aa  100  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  33.87 
 
 
566 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
254 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
426 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1025  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
229 aa  96.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6639  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 
281 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  hitchhiker  0.000186987 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2937  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 
227 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1998  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
235 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  32.06 
 
 
566 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2518  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 
497 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 
497 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1969  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  35.51 
 
 
484 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4500  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  35.27 
 
 
500 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  28.52 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0607  MutT/nudix family protein  34.76 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0572  MutT/nudix family protein  34.76 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2625  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0419  hypothetical protein  38.18 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3574  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3674  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1351  NUDIX hydrolase  29.15 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6674  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
251 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.702722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2339  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2075  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
225 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2382  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2659  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2822  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
225 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.473319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7413  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
238 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3348  NUDIX hydrolase  28.71 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2827  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
225 aa  59.3  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147505  normal  0.410276 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2180  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
242 aa  59.3  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0550608  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03822  NUDIX family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03600)  26.45 
 
 
398 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409297  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3862  NUDIX hydrolase  29.88 
 
 
244 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2343  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
228 aa  55.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0102675  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2440  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200003  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3137  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
222 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2828  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
255 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0852526  normal  0.646484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1500  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 
242 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3980  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
239 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301883  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4736  putative NUDIX hydrolase  28.92 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3036  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103793  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2236  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
244 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0182426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>