68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3396 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3396  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3177  NUDIX hydrolase  82.51 
 
 		 303 aa  514  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.334234 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18290  putative hydrolase, NUDIX family domain protein  36.52 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260549  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  39.8 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0284  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.144667 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 247 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 274 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  38.74 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0328  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121747  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 		 289 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1855  NUDIX hydrolase  36.12 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0337  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 290 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  34.55 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5313  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723255 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  29.77 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22420  NUDIX family protein  41.4 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2088  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1904  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1857  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1838  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13056  hypothetical protein  35.86 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  34.87 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0331  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 368 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 263 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 		 545 aa  79.7  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  30.73 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  30.54 
 
 		 550 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  30.93 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 426 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  29.38 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 		 557 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 556 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02770  NUDIX family protein  30.1 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  29.32 
 
 		 566 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  36.42 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6639  NUDIX hydrolase  25.63 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  hitchhiker  0.000186987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 		 559 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2625  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 		 244 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  27.84 
 
 		 562 aa  56.2  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  32.14 
 
 		 500 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 568 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 		 568 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 		 497 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 		 497 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0114  NUDIX hydrolase  23.21 
 
 		 215 aa  49.3  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0755049  normal  0.156914 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03822  NUDIX family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03600)  30.17 
 
 		 398 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  22.84 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4500  NUDIX hydrolase  26.18 
 
 		 267 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2937  NUDIX hydrolase  24.44 
 
 		 227 aa  45.8  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0419  hypothetical protein  29.38 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2075  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1969  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2343  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 228 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 207 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2659  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 257 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>