93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0202 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  100 
 
 
295 aa  569  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  71.21 
 
 
275 aa  368  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  60.77 
 
 
285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  59.69 
 
 
310 aa  296  3e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  60.18 
 
 
289 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0337  NUDIX hydrolase  56.64 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  59.55 
 
 
264 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5313  NUDIX hydrolase  51.13 
 
 
297 aa  239  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.723255 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  54.92 
 
 
281 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  55.02 
 
 
279 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  52.97 
 
 
274 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0284  NUDIX hydrolase  49.4 
 
 
296 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.144667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0328  NUDIX hydrolase  54.42 
 
 
297 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121747  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  46.4 
 
 
315 aa  203  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0331  NUDIX hydrolase  44.76 
 
 
368 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  53.28 
 
 
272 aa  203  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13056  hypothetical protein  51.45 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1857  NUDIX hydrolase  49.19 
 
 
275 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1904  NUDIX hydrolase  49.19 
 
 
275 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269642  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2088  NUDIX hydrolase  48.95 
 
 
277 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1838  NUDIX hydrolase  49.19 
 
 
275 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181353  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  47.95 
 
 
283 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  51.54 
 
 
247 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1855  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 
278 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22420  NUDIX family protein  46.64 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  45.64 
 
 
290 aa  159  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3177  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 
303 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.334234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  40.78 
 
 
294 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3396  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
303 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  39.43 
 
 
263 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  40.6 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  38.53 
 
 
545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  38.02 
 
 
267 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  38.8 
 
 
264 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0114  NUDIX hydrolase  34.87 
 
 
215 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0755049  normal  0.156914 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
273 aa  122  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  40.34 
 
 
556 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  39.82 
 
 
550 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  37.13 
 
 
562 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02770  NUDIX family protein  38.2 
 
 
300 aa  113  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  39.55 
 
 
557 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  36.43 
 
 
544 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
260 aa  110  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  38.93 
 
 
566 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  38.33 
 
 
568 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
254 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  37.96 
 
 
568 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
426 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
556 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1998  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
235 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 
559 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6639  NUDIX hydrolase  35.68 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  hitchhiker  0.000186987 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  33.76 
 
 
566 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2518  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
261 aa  93.6  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158664  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18290  putative hydrolase, NUDIX family domain protein  39.77 
 
 
300 aa  92.4  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260549  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2937  NUDIX hydrolase  31.49 
 
 
227 aa  89.4  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1025  NUDIX hydrolase  33.76 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  29.62 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  37.26 
 
 
484 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  38.92 
 
 
497 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  38.92 
 
 
497 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  38.42 
 
 
500 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1969  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
275 aa  77  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4500  NUDIX hydrolase  32.68 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2625  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 
244 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2659  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2382  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6674  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.702722 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0607  MutT/nudix family protein  34.17 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0572  MutT/nudix family protein  34.17 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2339  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3574  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7413  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3862  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3137  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
222 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.260415 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03822  NUDIX family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03600)  29.31 
 
 
398 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409297  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0419  hypothetical protein  37.89 
 
 
225 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4736  putative NUDIX hydrolase  35.03 
 
 
256 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2075  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
225 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1351  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
248 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2827  NUDIX hydrolase  35 
 
 
225 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147505  normal  0.410276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2822  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 
225 aa  59.3  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.473319 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3348  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 
249 aa  58.9  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2440  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 
246 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200003  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3674  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
246 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1500  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3036  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103793  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2236  NUDIX hydrolase  33 
 
 
244 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0182426 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2180  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 
242 aa  53.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0550608  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2343  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 
228 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0102675  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2828  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
255 aa  46.6  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0852526  normal  0.646484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0929  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
238 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.89516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2416  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
252 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00201354  normal  0.156459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>