96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3570 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  100 
 
 
254 aa  501  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  50.76 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 
264 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 
264 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
263 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  42.63 
 
 
267 aa  165  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  35.6 
 
 
545 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 
294 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 
247 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  36.25 
 
 
566 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  41.3 
 
 
556 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  37.02 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6639  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  hitchhiker  0.000186987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2088  NUDIX hydrolase  35.95 
 
 
277 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  37.55 
 
 
544 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  37.3 
 
 
557 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
222 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  35.27 
 
 
283 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22420  NUDIX family protein  36.14 
 
 
313 aa  105  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  40.5 
 
 
550 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  34.45 
 
 
566 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
260 aa  103  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4500  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
267 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  38.36 
 
 
562 aa  102  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1857  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
275 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1904  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
275 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269642  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1838  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
275 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181353  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  35.55 
 
 
275 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
426 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  38.65 
 
 
568 aa  99.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  37.05 
 
 
559 aa  99.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 
568 aa  99.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13056  hypothetical protein  32.64 
 
 
288 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  33.47 
 
 
310 aa  95.5  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2518  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158664  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1969  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
275 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5313  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
297 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.723255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  32.51 
 
 
315 aa  89  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 
556 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0331  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 
368 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  32.88 
 
 
281 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02770  NUDIX family protein  29.82 
 
 
300 aa  85.1  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0337  NUDIX hydrolase  33.48 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1855  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  33.65 
 
 
290 aa  82  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0328  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121747  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2937  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 
227 aa  79  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0284  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.144667 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3396  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1025  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 
229 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3177  NUDIX hydrolase  30 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.334234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0114  NUDIX hydrolase  27.73 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0755049  normal  0.156914 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1998  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3862  NUDIX hydrolase  33.19 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2075  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2339  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  31.47 
 
 
500 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2625  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0419  hypothetical protein  35.48 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2382  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4736  putative NUDIX hydrolase  33.74 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  30.96 
 
 
497 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  30.96 
 
 
497 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2659  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2440  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200003  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2236  NUDIX hydrolase  33.69 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0182426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3574  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0607  MutT/nudix family protein  30.82 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3036  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103793  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0572  MutT/nudix family protein  30.82 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3674  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1351  NUDIX hydrolase  31.66 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03822  NUDIX family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03600)  26.79 
 
 
398 aa  56.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409297  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6674  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.702722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7413  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  31.31 
 
 
484 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2180  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0550608  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3348  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1500  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
242 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2828  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
255 aa  52  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0852526  normal  0.646484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0929  NUDIX hydrolase  27.72 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.89516 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2343  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0102675  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2822  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.473319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2461  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
199 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442515  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1280  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 
226 aa  48.5  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0919389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2827  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
225 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147505  normal  0.410276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3538  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3137  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
222 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2416  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 
252 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00201354  normal  0.156459 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18290  putative hydrolase, NUDIX family domain protein  28.12 
 
 
300 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>