79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0284 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0284  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 296 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.144667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0328  NUDIX hydrolase  87.21 
 
 		 297 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121747  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  48.88 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  48.88 
 
 		 275 aa  222  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0337  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  53.02 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  51.44 
 
 		 289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  47.58 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  48.69 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5313  NUDIX hydrolase  45.49 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  47.72 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0331  NUDIX hydrolase  41.75 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1904  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1857  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1838  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 275 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13056  hypothetical protein  45.87 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  45.63 
 
 		 281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  42.17 
 
 		 283 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1855  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 		 278 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2088  NUDIX hydrolase  40.93 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  41.7 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  45.67 
 
 		 247 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  44.5 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22420  NUDIX family protein  40.25 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0114  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 215 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0755049  normal  0.156914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3396  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3177  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.334234 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02770  NUDIX family protein  42.93 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  36.55 
 
 		 550 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  35.65 
 
 		 566 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  37.17 
 
 		 545 aa  96.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  33.21 
 
 		 426 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  33.45 
 
 		 568 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6639  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  hitchhiker  0.000186987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  36.14 
 
 		 559 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  33.59 
 
 		 556 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  33.45 
 
 		 568 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 		 557 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  34.56 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 566 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18290  putative hydrolase, NUDIX family domain protein  35.15 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  34.66 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 544 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  32.9 
 
 		 556 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1998  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  35.4 
 
 		 497 aa  79  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  35.4 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  36.79 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  35.27 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1025  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 229 aa  67  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2937  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03822  NUDIX family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03600)  23.19 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1969  NUDIX hydrolase  30.38 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2625  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4500  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2518  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2827  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 225 aa  52.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147505  normal  0.410276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2659  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 257 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2382  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 		 257 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2339  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 245 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3137  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3348  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0607  MutT/nudix family protein  29.17 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0572  MutT/nudix family protein  29.17 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2828  NUDIX hydrolase  31.44 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0852526  normal  0.646484 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3674  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2440  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 246 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200003  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2075  NUDIX hydrolase  33.19 
 
 		 225 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3862  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 		 244 aa  42.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>