90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2625 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2625  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 244 aa  502  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2828  NUDIX hydrolase  54.88 
 
 		 255 aa  244  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0852526  normal  0.646484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3574  NUDIX hydrolase  43.27 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1351  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3862  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 		 244 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6674  NUDIX hydrolase  43.17 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.702722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7413  NUDIX hydrolase  40.93 
 
 		 238 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2659  NUDIX hydrolase  42.91 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2382  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 		 257 aa  164  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2339  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3036  NUDIX hydrolase  44.5 
 
 		 251 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103793  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2440  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200003  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2180  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 		 242 aa  158  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0550608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4736  putative NUDIX hydrolase  41.84 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1500  NUDIX hydrolase  46.33 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2236  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0182426 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0572  MutT/nudix family protein  44.44 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0607  MutT/nudix family protein  44.44 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3674  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 246 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3538  NUDIX hydrolase  45.87 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2343  NUDIX hydrolase  44.13 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2416  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00201354  normal  0.156459 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3137  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0419  hypothetical protein  41.78 
 
 		 225 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2827  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147505  normal  0.410276 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3348  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2075  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2822  NUDIX hydrolase  40.67 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.473319 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1280  NUDIX hydrolase  44.6 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0919389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3980  NUDIX hydrolase  41.47 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0929  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.89516 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  36.9 
 
 		 310 aa  88.6  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 		 545 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0337  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  31.58 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5313  NUDIX hydrolase  32.78 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723255 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  31.38 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 		 295 aa  72  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1855  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 294 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  27.73 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22420  NUDIX family protein  29.19 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  28.27 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  28.31 
 
 		 550 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  30.41 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2518  NUDIX hydrolase  32.7 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1025  NUDIX hydrolase  29.56 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0331  NUDIX hydrolase  28.64 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0284  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.144667 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1904  NUDIX hydrolase  31.89 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1838  NUDIX hydrolase  31.89 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1857  NUDIX hydrolase  31.89 
 
 		 275 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  28.32 
 
 		 566 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3396  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1998  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1969  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6639  NUDIX hydrolase  25.62 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  hitchhiker  0.000186987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 283 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2088  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  36.04 
 
 		 568 aa  52.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  36.04 
 
 		 568 aa  52  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 		 556 aa  52  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  26.97 
 
 		 566 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 		 556 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4500  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3177  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 303 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.334234 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  30.37 
 
 		 562 aa  48.9  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18290  putative hydrolase, NUDIX family domain protein  25 
 
 		 300 aa  47.8  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260549  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02770  NUDIX family protein  27.55 
 
 		 300 aa  46.2  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0328  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121747  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0114  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 		 215 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0755049  normal  0.156914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2937  NUDIX hydrolase  25.53 
 
 		 227 aa  45.4  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  31.48 
 
 		 544 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03822  NUDIX family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03600)  23.2 
 
 		 398 aa  42.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 557 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>