79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3538 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3538  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3036  NUDIX hydrolase  83.6 
 
 		 251 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103793  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2416  NUDIX hydrolase  86.06 
 
 		 252 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00201354  normal  0.156459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4736  putative NUDIX hydrolase  80.47 
 
 		 256 aa  411  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2236  NUDIX hydrolase  75.97 
 
 		 244 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0182426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2440  NUDIX hydrolase  75.74 
 
 		 246 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200003  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3862  NUDIX hydrolase  45.2 
 
 		 244 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6674  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.702722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7413  NUDIX hydrolase  46.93 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3574  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2339  NUDIX hydrolase  45.5 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1351  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2382  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2659  NUDIX hydrolase  44.14 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2625  NUDIX hydrolase  45.87 
 
 		 244 aa  168  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3348  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2828  NUDIX hydrolase  44.21 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0852526  normal  0.646484 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0572  MutT/nudix family protein  42.01 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0607  MutT/nudix family protein  42.01 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3674  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0419  hypothetical protein  45.37 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1500  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2180  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0550608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2343  NUDIX hydrolase  42.6 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2075  NUDIX hydrolase  44.91 
 
 		 225 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3137  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2822  NUDIX hydrolase  40.93 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.473319 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1280  NUDIX hydrolase  45.69 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0919389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3980  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2827  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147505  normal  0.410276 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0929  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.89516 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  34.55 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 545 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1025  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  33.74 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0337  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5313  NUDIX hydrolase  32.4 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4500  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  31.64 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  30.77 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  32.12 
 
 		 556 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  30.45 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  29.83 
 
 		 550 aa  52  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2518  NUDIX hydrolase  28.31 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158664  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22420  NUDIX family protein  29.84 
 
 		 313 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  29.74 
 
 		 566 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  29.15 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6639  NUDIX hydrolase  26.97 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  hitchhiker  0.000186987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 		 568 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 		 568 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  30.98 
 
 		 315 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1998  NUDIX hydrolase  30.27 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2088  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0331  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 368 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1838  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  31.49 
 
 		 544 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1969  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1904  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1857  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  30.73 
 
 		 562 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  29.88 
 
 		 426 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2937  NUDIX hydrolase  27.04 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1855  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>