91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1959 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 426 aa  850    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  42.95 
 
 		 566 aa  325  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  43.74 
 
 		 566 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  39.26 
 
 		 545 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 273 aa  126  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  35.69 
 
 		 550 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 247 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 		 556 aa  113  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 		 263 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 		 544 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  36.12 
 
 		 267 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 294 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  31.17 
 
 		 556 aa  106  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 264 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 295 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 		 557 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 275 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 568 aa  100  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 264 aa  100  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 254 aa  100  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 		 559 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  30.99 
 
 		 562 aa  98.6  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 285 aa  96.3  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 272 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 		 568 aa  95.9  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0328  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 		 297 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121747  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 264 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 279 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 260 aa  94.4  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 283 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02770  NUDIX family protein  35.07 
 
 		 300 aa  93.6  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0284  NUDIX hydrolase  33.21 
 
 		 296 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.144667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2088  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 277 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 274 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  34.69 
 
 		 290 aa  89.7  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  31.17 
 
 		 310 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  32.49 
 
 		 281 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0331  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 368 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0337  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 290 aa  87.4  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6639  NUDIX hydrolase  33.17 
 
 		 281 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  hitchhiker  0.000186987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 289 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5313  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22420  NUDIX family protein  33.01 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1855  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2518  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158664  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1838  NUDIX hydrolase  33.84 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1904  NUDIX hydrolase  33.84 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1857  NUDIX hydrolase  33.84 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13056  hypothetical protein  31.87 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3177  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.334234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1998  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2075  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3396  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 303 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0419  hypothetical protein  33.78 
 
 		 225 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18290  putative hydrolase, NUDIX family domain protein  32.2 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.260549  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2937  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 		 227 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4500  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1025  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4385  beta-lactamase domain-containing protein  32.76 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.113297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2828  NUDIX hydrolase  32.13 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0852526  normal  0.646484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6674  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.702722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3862  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 244 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2822  NUDIX hydrolase  32.44 
 
 		 225 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.473319 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3137  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2625  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 497 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 497 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3348  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 249 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7413  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 238 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1969  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 275 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2382  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 		 257 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2659  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 		 257 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03822  NUDIX family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03600)  27.65 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2343  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 228 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  29.76 
 
 		 500 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0114  NUDIX hydrolase  29.83 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0755049  normal  0.156914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2339  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 245 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1351  NUDIX hydrolase  29.49 
 
 		 248 aa  50.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2180  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 242 aa  50.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0550608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4736  putative NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 256 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0607  MutT/nudix family protein  32.37 
 
 		 243 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0572  MutT/nudix family protein  32.37 
 
 		 243 aa  47.4  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1500  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 		 242 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2440  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 		 246 aa  47  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3574  NUDIX hydrolase  27.73 
 
 		 248 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2416  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 252 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00201354  normal  0.156459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3036  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 251 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103793  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2461  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 199 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3980  NUDIX hydrolase  32.6 
 
 		 239 aa  43.1  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>