81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2440 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2440  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 246 aa  495  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200003  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3036  NUDIX hydrolase  71.84 
 
 		 251 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103793  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4736  putative NUDIX hydrolase  67.58 
 
 		 256 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3538  NUDIX hydrolase  75.74 
 
 		 251 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2416  NUDIX hydrolase  70.78 
 
 		 252 aa  340  9e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00201354  normal  0.156459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2236  NUDIX hydrolase  67.48 
 
 		 244 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0182426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3574  NUDIX hydrolase  49.25 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2339  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 245 aa  188  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2382  NUDIX hydrolase  47.11 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.673609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2659  NUDIX hydrolase  47.11 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3862  NUDIX hydrolase  43.44 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7413  NUDIX hydrolase  46.29 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6674  NUDIX hydrolase  45.41 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.702722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1351  NUDIX hydrolase  43.56 
 
 		 248 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3348  NUDIX hydrolase  43.11 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2625  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3674  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0572  MutT/nudix family protein  42.86 
 
 		 243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0607  MutT/nudix family protein  42.86 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2828  NUDIX hydrolase  41.31 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0852526  normal  0.646484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3137  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2180  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0550608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1500  NUDIX hydrolase  41.55 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1280  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0919389 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0419  hypothetical protein  42.01 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2343  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2075  NUDIX hydrolase  41.55 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2822  NUDIX hydrolase  40.2 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.473319 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0929  NUDIX hydrolase  37.92 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.89516 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3980  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2827  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147505  normal  0.410276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2913  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0466  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0115  hypothetical protein  32.34 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3570  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5313  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 		 297 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723255 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25420  NUDIX family protein  29.94 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 545 aa  59.3  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0235  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.998235  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  38.05 
 
 		 568 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0337  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  38.05 
 
 		 568 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0202  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0949289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0516  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8909  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4852  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  34.82 
 
 		 556 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36160  NUDIX family protein  29.7 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2699  NUDIX hydrolase  31.89 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3275  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.424821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3602  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 263 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5001  hypothetical protein  28.9 
 
 		 267 aa  52  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2700  NUDIX hydrolase  27.32 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.805281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3111  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  28.05 
 
 		 550 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4283  NUDIX hydrolase  27.31 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.918616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0247  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6639  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0811428  hitchhiker  0.000186987 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22420  NUDIX family protein  28.76 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  28.93 
 
 		 566 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1558  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.435386  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 		 559 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2354  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.081221  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4271  NUDIX hydrolase  25.1 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1025  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0715  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1959  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 		 426 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0680964  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  30.61 
 
 		 562 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2088  NUDIX hydrolase  24.79 
 
 		 277 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1998  NUDIX hydrolase  27.71 
 
 		 235 aa  45.8  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2518  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4500  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2937  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1838  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1855  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.450228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0284  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.144667 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 		 557 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1857  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1904  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 544 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>