More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1266 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0222  elongation factor G  50.59 
 
 
683 aa  684    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3749  elongation factor G  53.57 
 
 
688 aa  711    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.158222  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4182  elongation factor G  53.07 
 
 
686 aa  659    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2225  elongation factor G  50.22 
 
 
680 aa  683    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6425  elongation factor G  52.17 
 
 
681 aa  699    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1266  elongation factor G  100 
 
 
684 aa  1379    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.782059  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3719  elongation factor G  53.98 
 
 
700 aa  708    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252538 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5542  elongation factor G  53.51 
 
 
686 aa  671    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1382  elongation factor G  51.26 
 
 
684 aa  674    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3200  elongation factor G  47.75 
 
 
682 aa  645    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2663  elongation factor G  47.85 
 
 
682 aa  667    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1118  elongation factor G  48.58 
 
 
682 aa  654    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3402  elongation factor G  54.04 
 
 
730 aa  718    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0312369 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000680  translation elongation factor G-related protein  45.82 
 
 
674 aa  631  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  33.82 
 
 
695 aa  426  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  31.72 
 
 
692 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  32.03 
 
 
688 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  35.42 
 
 
701 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  32.52 
 
 
696 aa  398  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  36.27 
 
 
690 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  34.34 
 
 
687 aa  389  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  35.11 
 
 
699 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  32.4 
 
 
683 aa  383  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  34.56 
 
 
682 aa  385  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  32.7 
 
 
691 aa  381  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  32.65 
 
 
696 aa  377  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  32.99 
 
 
696 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  34.93 
 
 
683 aa  378  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  30.95 
 
 
691 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  33.43 
 
 
690 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  33.58 
 
 
680 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  34.58 
 
 
707 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  32.9 
 
 
693 aa  371  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  35.12 
 
 
719 aa  372  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  34.24 
 
 
703 aa  372  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  34.35 
 
 
708 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  31.26 
 
 
690 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_002950  PG0933  elongation factor G  31.72 
 
 
719 aa  366  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.246025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  31.17 
 
 
693 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  31.16 
 
 
667 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  31.2 
 
 
685 aa  368  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  32.99 
 
 
673 aa  368  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  31.9 
 
 
703 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  30.84 
 
 
679 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  29.14 
 
 
696 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  31.48 
 
 
691 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  33.82 
 
 
686 aa  364  2e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  32.41 
 
 
683 aa  365  2e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  36.02 
 
 
701 aa  364  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0879  small GTP-binding protein  31.31 
 
 
690 aa  363  4e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.323736  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  31.43 
 
 
697 aa  363  4e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  29.55 
 
 
696 aa  363  4e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  33.09 
 
 
719 aa  363  7.0000000000000005e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  34.26 
 
 
683 aa  363  8e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  32.46 
 
 
682 aa  363  8e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  31.18 
 
 
694 aa  362  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  33.67 
 
 
681 aa  360  4e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  36.46 
 
 
717 aa  360  5e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  30.29 
 
 
695 aa  360  5e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7102  elongation factor G  31.97 
 
 
710 aa  359  8e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  32.84 
 
 
694 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  29.78 
 
 
694 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  31.08 
 
 
670 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  30.86 
 
 
691 aa  357  5.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  36.4 
 
 
717 aa  356  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  31.03 
 
 
692 aa  355  2e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2340  elongation factor G  34.22 
 
 
729 aa  355  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.468158  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  33.86 
 
 
714 aa  355  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  35.09 
 
 
677 aa  355  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  32.11 
 
 
697 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  31.13 
 
 
691 aa  353  5e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  30.65 
 
 
701 aa  350  6e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  29.37 
 
 
692 aa  349  9e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  31.33 
 
 
697 aa  347  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  30.65 
 
 
685 aa  346  6e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0059  small GTP-binding protein  34.06 
 
 
691 aa  346  8e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  33.38 
 
 
687 aa  346  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  31.88 
 
 
691 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  30.62 
 
 
673 aa  343  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  34.08 
 
 
656 aa  343  5e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  33.19 
 
 
691 aa  343  8e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  32.17 
 
 
692 aa  342  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.79 
 
 
682 aa  342  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0449  elongation factor G  30.89 
 
 
693 aa  341  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513034  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  31.64 
 
 
698 aa  341  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0290  small GTP-binding protein  34.75 
 
 
770 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  32.84 
 
 
688 aa  340  4e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  31.42 
 
 
694 aa  340  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0472  elongation factor G  31.77 
 
 
693 aa  340  5e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00749701  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  34.94 
 
 
687 aa  340  5.9999999999999996e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  30.79 
 
 
701 aa  339  8e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_415  translation elongation factor G  31.96 
 
 
693 aa  339  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000373207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  32.57 
 
 
701 aa  339  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  30.93 
 
 
691 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  30.72 
 
 
691 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  33.09 
 
 
701 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  32.25 
 
 
686 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  30.24 
 
 
693 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  32.55 
 
 
686 aa  336  7e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  30.76 
 
 
691 aa  336  1e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>