More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0277 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  75.84 
 
 
690 aa  1125    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  74.67 
 
 
691 aa  1100    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  76.09 
 
 
691 aa  1152    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  79.71 
 
 
693 aa  1174    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  100 
 
 
690 aa  1424    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  76.67 
 
 
691 aa  1127    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  75.84 
 
 
691 aa  1133    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  42.25 
 
 
707 aa  591  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  41.39 
 
 
695 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  39.79 
 
 
695 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  41.46 
 
 
679 aa  565  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  39.88 
 
 
692 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  39.83 
 
 
694 aa  546  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  39.74 
 
 
694 aa  544  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  39.16 
 
 
699 aa  536  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7102  elongation factor G  39.86 
 
 
710 aa  532  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  40.46 
 
 
694 aa  533  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  38.78 
 
 
696 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  38.12 
 
 
696 aa  527  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  38.49 
 
 
696 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  39 
 
 
697 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  38.33 
 
 
692 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  38.47 
 
 
689 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  38.66 
 
 
697 aa  521  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  37.26 
 
 
691 aa  522  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  38.46 
 
 
688 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  38.12 
 
 
701 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  36.38 
 
 
696 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  38.8 
 
 
697 aa  515  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  37.77 
 
 
673 aa  510  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  37.39 
 
 
694 aa  511  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  38.45 
 
 
701 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  38.12 
 
 
692 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  38.17 
 
 
680 aa  507  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  38.39 
 
 
673 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  37.9 
 
 
682 aa  505  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0933  elongation factor G  36.58 
 
 
719 aa  501  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.246025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  38.14 
 
 
667 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  37.55 
 
 
670 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  36.42 
 
 
697 aa  499  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  36.32 
 
 
693 aa  499  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  37.3 
 
 
701 aa  498  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  37.45 
 
 
701 aa  498  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  36.27 
 
 
692 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  36.27 
 
 
692 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  36.27 
 
 
692 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  36.27 
 
 
692 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  36.27 
 
 
692 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  36.56 
 
 
692 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  38.31 
 
 
703 aa  495  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  36.27 
 
 
692 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  36.27 
 
 
692 aa  491  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  36.27 
 
 
692 aa  491  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  36.07 
 
 
692 aa  489  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  36.12 
 
 
692 aa  491  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  37.57 
 
 
697 aa  492  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  36.08 
 
 
703 aa  491  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  36.27 
 
 
692 aa  492  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  36.35 
 
 
691 aa  487  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  35.35 
 
 
693 aa  489  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  38.61 
 
 
682 aa  487  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  37.19 
 
 
693 aa  488  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  37.41 
 
 
691 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  35.96 
 
 
692 aa  484  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  35.44 
 
 
691 aa  483  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  36.86 
 
 
692 aa  479  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0570  elongation factor G  35.92 
 
 
693 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  36.83 
 
 
696 aa  479  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  36.1 
 
 
697 aa  481  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0584  elongation factor G  35.92 
 
 
693 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768044  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  36.4 
 
 
699 aa  478  1e-133  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  35.1 
 
 
695 aa  476  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  36.24 
 
 
691 aa  478  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  36.55 
 
 
699 aa  479  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  35.54 
 
 
691 aa  478  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  36.26 
 
 
691 aa  478  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  36.32 
 
 
689 aa  473  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  35.84 
 
 
698 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  35.17 
 
 
701 aa  474  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  35.74 
 
 
691 aa  472  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  35.4 
 
 
698 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  35.15 
 
 
698 aa  473  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  36.79 
 
 
692 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  35.76 
 
 
694 aa  474  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  35.46 
 
 
698 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  35.46 
 
 
698 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  35.4 
 
 
698 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  37.66 
 
 
695 aa  474  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  35.4 
 
 
698 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  35.4 
 
 
698 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  35.31 
 
 
698 aa  472  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  36.18 
 
 
691 aa  474  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  35.29 
 
 
692 aa  473  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  35.23 
 
 
706 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  36.03 
 
 
692 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  34.74 
 
 
697 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  34.88 
 
 
701 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  35.98 
 
 
683 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  34.74 
 
 
693 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  35.25 
 
 
698 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>