More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1453 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  100 
 
 		 677 aa  1354    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  41 
 
 		 696 aa  547  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  44.89 
 
 		 656 aa  548  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  41.37 
 
 		 695 aa  548  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  40.5 
 
 		 694 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  42.39 
 
 		 680 aa  522  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  39.91 
 
 		 695 aa  519  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  39.67 
 
 		 682 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2121  small GTP-binding protein  46.15 
 
 		 658 aa  518  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  37.74 
 
 		 692 aa  511  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  40.21 
 
 		 696 aa  509  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  38.77 
 
 		 691 aa  511  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  39.68 
 
 		 697 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  38.78 
 
 		 701 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  38.55 
 
 		 697 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  39.62 
 
 		 694 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  39.59 
 
 		 694 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  38.62 
 
 		 697 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  37.41 
 
 		 688 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  37.21 
 
 		 696 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  37.21 
 
 		 696 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  38.47 
 
 		 679 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  39.35 
 
 		 673 aa  501  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  38.34 
 
 		 701 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  39.76 
 
 		 683 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  40.48 
 
 		 690 aa  492  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  39.25 
 
 		 701 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  39.82 
 
 		 691 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  39.67 
 
 		 683 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  40.38 
 
 		 703 aa  490  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  38.07 
 
 		 670 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  39.62 
 
 		 686 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  38.35 
 
 		 682 aa  487  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  39.07 
 
 		 686 aa  482  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  38.12 
 
 		 667 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  38.03 
 
 		 692 aa  484  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  37.37 
 
 		 685 aa  483  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  38.82 
 
 		 673 aa  481  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  38.19 
 
 		 692 aa  481  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  36.91 
 
 		 691 aa  480  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  37.54 
 
 		 692 aa  482  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  37.26 
 
 		 689 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  38.13 
 
 		 683 aa  478  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.85 
 
 		 682 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  38.26 
 
 		 685 aa  476  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  38.02 
 
 		 691 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  37.15 
 
 		 692 aa  475  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  38.94 
 
 		 697 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  38.94 
 
 		 686 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  36.32 
 
 		 691 aa  475  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  37.17 
 
 		 691 aa  473  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  38.25 
 
 		 707 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  38.02 
 
 		 691 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  37.28 
 
 		 691 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  37.87 
 
 		 683 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  35.8 
 
 		 692 aa  466  9.999999999999999e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  40.95 
 
 		 717 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  36.02 
 
 		 696 aa  464  1e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  36.31 
 
 		 694 aa  462  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  35.23 
 
 		 697 aa  463  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  37.21 
 
 		 703 aa  464  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  40.15 
 
 		 688 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  37.5 
 
 		 697 aa  463  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2404  small GTP-binding protein  40.26 
 
 		 718 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136608  normal  0.0116105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  39.43 
 
 		 719 aa  462  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  36.51 
 
 		 691 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  36.38 
 
 		 691 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  35.32 
 
 		 692 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  35.2 
 
 		 693 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  35.64 
 
 		 690 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  40.12 
 
 		 701 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  35.94 
 
 		 697 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  39.59 
 
 		 697 aa  461  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  35.77 
 
 		 692 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  36.8 
 
 		 698 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  35.24 
 
 		 692 aa  456  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  34.68 
 
 		 693 aa  457  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  40.58 
 
 		 717 aa  458  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  35.64 
 
 		 698 aa  457  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  36.06 
 
 		 692 aa  458  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  36.71 
 
 		 701 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  35.2 
 
 		 691 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  35.64 
 
 		 698 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  35.64 
 
 		 698 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  36.56 
 
 		 702 aa  459  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  35.44 
 
 		 691 aa  457  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  35.79 
 
 		 698 aa  458  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  35.79 
 
 		 698 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  35.58 
 
 		 693 aa  456  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  35.39 
 
 		 697 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  35.39 
 
 		 691 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  35.5 
 
 		 698 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  35.94 
 
 		 691 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  35.64 
 
 		 698 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  36.4 
 
 		 700 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  36.55 
 
 		 700 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  36.4 
 
 		 700 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  39.68 
 
 		 701 aa  455  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  35.65 
 
 		 691 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3807  elongation factor G  36.4 
 
 		 700 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>