More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1762 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  52.1 
 
 
679 aa  698    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  49.71 
 
 
695 aa  689    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  44.43 
 
 
696 aa  646    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  73.46 
 
 
670 aa  1021    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  45.14 
 
 
695 aa  638    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.55 
 
 
692 aa  697    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  48.03 
 
 
694 aa  657    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  54.93 
 
 
680 aa  751    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  50.07 
 
 
694 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  100 
 
 
667 aa  1368    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  47.55 
 
 
696 aa  673    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  47.41 
 
 
696 aa  671    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  55.22 
 
 
682 aa  772    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  62.26 
 
 
673 aa  853    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  54.71 
 
 
673 aa  752    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  47.24 
 
 
682 aa  632  1e-180  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  42.63 
 
 
701 aa  609  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  44.51 
 
 
691 aa  606  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  43.6 
 
 
697 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  44.41 
 
 
694 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  43.48 
 
 
692 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  42.86 
 
 
697 aa  599  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  43.13 
 
 
683 aa  595  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  42.77 
 
 
701 aa  597  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  43.62 
 
 
697 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  43.78 
 
 
686 aa  591  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  43.78 
 
 
683 aa  590  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  43.76 
 
 
691 aa  589  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  43.96 
 
 
689 aa  591  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  41.57 
 
 
694 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  44.81 
 
 
696 aa  588  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  43.91 
 
 
692 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  42.75 
 
 
690 aa  588  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  43.59 
 
 
692 aa  588  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  42.58 
 
 
691 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  43.04 
 
 
692 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  43.47 
 
 
692 aa  580  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  42.75 
 
 
692 aa  580  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  42.9 
 
 
692 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  42.9 
 
 
692 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  42.75 
 
 
692 aa  578  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  43.81 
 
 
690 aa  580  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  42.9 
 
 
692 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  43.04 
 
 
692 aa  581  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  42.75 
 
 
692 aa  579  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  42.73 
 
 
691 aa  581  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  41.68 
 
 
697 aa  579  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  42.75 
 
 
692 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  43.22 
 
 
689 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  42.61 
 
 
692 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  43.7 
 
 
691 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  42.57 
 
 
689 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  44.12 
 
 
692 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  42.44 
 
 
692 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  42.2 
 
 
692 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  43.17 
 
 
692 aa  570  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  43.44 
 
 
689 aa  571  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  42.27 
 
 
692 aa  565  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  43.13 
 
 
691 aa  568  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  42.11 
 
 
697 aa  567  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  41.01 
 
 
699 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  42.38 
 
 
692 aa  563  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  41.43 
 
 
701 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  41.35 
 
 
697 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  41.51 
 
 
691 aa  564  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  41.35 
 
 
697 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  43.19 
 
 
697 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  42.94 
 
 
691 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  42.11 
 
 
692 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  41.35 
 
 
697 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  41.82 
 
 
699 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  41.45 
 
 
698 aa  561  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  41.42 
 
 
691 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  42 
 
 
692 aa  561  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  41.52 
 
 
692 aa  559  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  40.87 
 
 
699 aa  560  1e-158  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  41.82 
 
 
699 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  41.85 
 
 
692 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  41.51 
 
 
693 aa  557  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  40.75 
 
 
701 aa  557  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  41.41 
 
 
692 aa  556  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  41.38 
 
 
691 aa  555  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  41.37 
 
 
701 aa  556  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37710  elongation factor G  40.38 
 
 
702 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  40.78 
 
 
688 aa  558  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3223  elongation factor G  40.67 
 
 
730 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  40.57 
 
 
703 aa  553  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  41.82 
 
 
693 aa  553  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  42.07 
 
 
694 aa  554  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  41.92 
 
 
694 aa  554  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  42.11 
 
 
686 aa  554  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  41.62 
 
 
691 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  41.62 
 
 
691 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0793  translation elongation factor G  40.77 
 
 
695 aa  553  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0928  elongation factor G  42.63 
 
 
701 aa  552  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.082436  hitchhiker  0.00424173 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  41.03 
 
 
691 aa  553  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  41.27 
 
 
701 aa  552  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  41.41 
 
 
691 aa  552  1e-156  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  41.23 
 
 
693 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  41.84 
 
 
693 aa  552  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>