More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0656 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  47.08 
 
 
692 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  45.76 
 
 
697 aa  645    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  77.89 
 
 
697 aa  1112    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  48.31 
 
 
692 aa  677    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  48.03 
 
 
688 aa  645    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  45.1 
 
 
693 aa  639    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  47.9 
 
 
698 aa  652    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  48.91 
 
 
687 aa  659    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  47.45 
 
 
691 aa  657    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  48.4 
 
 
692 aa  675    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  47.95 
 
 
692 aa  673    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  45.16 
 
 
692 aa  647    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  48.6 
 
 
685 aa  651    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  48.09 
 
 
692 aa  672    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  48.09 
 
 
692 aa  672    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  48.39 
 
 
692 aa  676    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  46.26 
 
 
688 aa  641    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1083  translation elongation factor G  46.1 
 
 
699 aa  638    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488496  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  46.49 
 
 
694 aa  635    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  45.47 
 
 
697 aa  649    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  47.7 
 
 
704 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  45.36 
 
 
692 aa  643    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  47.65 
 
 
692 aa  673    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  45.2 
 
 
699 aa  640    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  47.81 
 
 
689 aa  667    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  47.46 
 
 
700 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  48.97 
 
 
691 aa  668    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  46.38 
 
 
697 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  46.03 
 
 
692 aa  654    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  58.82 
 
 
692 aa  861    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  44.94 
 
 
695 aa  656    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  46.65 
 
 
691 aa  657    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  84.15 
 
 
694 aa  1229    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  45.32 
 
 
691 aa  638    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  45.07 
 
 
692 aa  638    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  46.47 
 
 
692 aa  653    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  47.87 
 
 
692 aa  668    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  76.45 
 
 
697 aa  1122    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  48.91 
 
 
686 aa  683    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  48.09 
 
 
692 aa  672    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  47.95 
 
 
692 aa  673    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  46.94 
 
 
691 aa  647    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  46.22 
 
 
696 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  48.39 
 
 
691 aa  672    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  48.78 
 
 
680 aa  666    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  49.71 
 
 
692 aa  689    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  49.12 
 
 
689 aa  685    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  45.61 
 
 
697 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  47.45 
 
 
698 aa  636    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  46.36 
 
 
679 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  46.87 
 
 
697 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  46.48 
 
 
692 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  46.36 
 
 
690 aa  649    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  48.39 
 
 
692 aa  676    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  46.83 
 
 
691 aa  652    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  49.35 
 
 
692 aa  724    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  77.34 
 
 
697 aa  1138    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  50.15 
 
 
691 aa  707    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  46.05 
 
 
697 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  45.31 
 
 
701 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  48.98 
 
 
688 aa  674    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  49.34 
 
 
691 aa  694    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  44.92 
 
 
696 aa  635    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  47.23 
 
 
697 aa  655    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  47.51 
 
 
692 aa  668    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47.27 
 
 
700 aa  637    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  84.74 
 
 
701 aa  1207    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  48.09 
 
 
692 aa  671    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  46.38 
 
 
698 aa  639    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  47.65 
 
 
689 aa  674    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  46.56 
 
 
690 aa  642    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  45.14 
 
 
699 aa  641    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  47.01 
 
 
682 aa  669    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  48.09 
 
 
692 aa  674    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  47.34 
 
 
703 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  46.75 
 
 
700 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  46.95 
 
 
700 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  49.93 
 
 
686 aa  689    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  44.72 
 
 
693 aa  642    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  49.42 
 
 
697 aa  676    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  46.41 
 
 
700 aa  635    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  48.39 
 
 
695 aa  675    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  55.59 
 
 
691 aa  801    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  45.78 
 
 
707 aa  645    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  45.47 
 
 
697 aa  649    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  46.85 
 
 
691 aa  644    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  48.33 
 
 
692 aa  678    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  100 
 
 
694 aa  1431    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  47.4 
 
 
692 aa  678    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  84.88 
 
 
701 aa  1232    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  47.3 
 
 
692 aa  659    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  46.05 
 
 
691 aa  634  1e-180  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  46.05 
 
 
691 aa  634  1e-180  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  47.17 
 
 
700 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  46.55 
 
 
691 aa  632  1e-180  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  47.17 
 
 
700 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  46.05 
 
 
691 aa  633  1e-180  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  47.31 
 
 
700 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3172  elongation factor G  47.17 
 
 
700 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  46.4 
 
 
700 aa  632  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>