More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1785 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  48.03 
 
 		 697 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  48.09 
 
 		 697 aa  655    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  50.15 
 
 		 701 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  64.56 
 
 		 686 aa  910    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  61.58 
 
 		 685 aa  863    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  47.37 
 
 		 692 aa  648    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  47.35 
 
 		 697 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  70.99 
 
 		 686 aa  1014    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  72.89 
 
 		 688 aa  1015    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  100 
 
 		 687 aa  1399    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  50 
 
 		 694 aa  672    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  50.29 
 
 		 701 aa  679    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  73.55 
 
 		 688 aa  1043    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  51.02 
 
 		 691 aa  706    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  48.91 
 
 		 694 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  47.19 
 
 		 691 aa  622  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  44.49 
 
 		 690 aa  581  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  42.25 
 
 		 692 aa  565  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  43.07 
 
 		 701 aa  568  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  41.86 
 
 		 695 aa  559  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  44.18 
 
 		 679 aa  560  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  43.26 
 
 		 696 aa  550  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  41.98 
 
 		 696 aa  549  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  43.48 
 
 		 680 aa  550  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  42.1 
 
 		 670 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  41.63 
 
 		 692 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  42.26 
 
 		 692 aa  541  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  39.71 
 
 		 692 aa  540  9.999999999999999e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  41.74 
 
 		 692 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  39.3 
 
 		 695 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  39.45 
 
 		 696 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  39.31 
 
 		 696 aa  538  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  40.53 
 
 		 689 aa  534  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  41.27 
 
 		 692 aa  532  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  41.57 
 
 		 697 aa  533  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  42.26 
 
 		 667 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  40.46 
 
 		 692 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  39.88 
 
 		 697 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  40.17 
 
 		 697 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  40.91 
 
 		 673 aa  525  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  40.2 
 
 		 694 aa  528  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  39.68 
 
 		 691 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  40.03 
 
 		 697 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  41.79 
 
 		 700 aa  520  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  40.03 
 
 		 697 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.35 
 
 		 682 aa  520  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  40.91 
 
 		 707 aa  521  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  39.86 
 
 		 692 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  39.8 
 
 		 692 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  40.2 
 
 		 697 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2717  elongation factor G  40.29 
 
 		 688 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2403  elongation factor G  40.44 
 
 		 688 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  40.09 
 
 		 692 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  39.21 
 
 		 689 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  39.56 
 
 		 697 aa  513  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  41.19 
 
 		 691 aa  514  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  38.73 
 
 		 693 aa  512  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  39.36 
 
 		 692 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  40.2 
 
 		 691 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  38.78 
 
 		 692 aa  511  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  39.36 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  40.56 
 
 		 688 aa  509  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  38.41 
 
 		 692 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  39.54 
 
 		 697 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  41.48 
 
 		 701 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  39.12 
 
 		 689 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  38.9 
 
 		 697 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  37.72 
 
 		 693 aa  508  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  38.34 
 
 		 692 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  38.19 
 
 		 692 aa  504  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  38.34 
 
 		 692 aa  503  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  38.48 
 
 		 692 aa  505  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  38.48 
 
 		 692 aa  505  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  38.34 
 
 		 692 aa  504  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  38.34 
 
 		 692 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  38.67 
 
 		 696 aa  504  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  39.23 
 
 		 673 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  39.56 
 
 		 688 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  38.48 
 
 		 691 aa  503  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  38.48 
 
 		 692 aa  505  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  38.34 
 
 		 692 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  40.29 
 
 		 683 aa  505  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  38.71 
 
 		 693 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  38.54 
 
 		 691 aa  504  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  39.94 
 
 		 682 aa  502  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  39.6 
 
 		 698 aa  499  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  38.34 
 
 		 692 aa  502  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  39.24 
 
 		 689 aa  501  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  38.05 
 
 		 692 aa  500  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  40.26 
 
 		 700 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  40.09 
 
 		 697 aa  500  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  39.22 
 
 		 698 aa  501  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  39.5 
 
 		 691 aa  502  1e-140  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  40.26 
 
 		 700 aa  502  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  38.26 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  39.39 
 
 		 696 aa  496  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  38.35 
 
 		 699 aa  498  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  38.35 
 
 		 699 aa  497  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  39.44 
 
 		 690 aa  498  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  38.12 
 
 		 692 aa  498  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>