More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2909 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  47.45 
 
 
697 aa  642    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  49.56 
 
 
692 aa  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  65.15 
 
 
685 aa  949    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  66.37 
 
 
688 aa  944    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  49.2 
 
 
694 aa  683    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  47.09 
 
 
697 aa  658    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  68.27 
 
 
688 aa  977    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  66.76 
 
 
686 aa  994    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  49.49 
 
 
701 aa  671    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  49.34 
 
 
701 aa  682    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  100 
 
 
686 aa  1405    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  49.93 
 
 
694 aa  689    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  48.17 
 
 
697 aa  673    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  64.56 
 
 
687 aa  910    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  53.32 
 
 
691 aa  741    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  50.79 
 
 
691 aa  691    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  45.2 
 
 
690 aa  621  1e-176  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  45.91 
 
 
679 aa  598  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  44.76 
 
 
696 aa  597  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  43.7 
 
 
696 aa  592  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  44.8 
 
 
670 aa  595  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  43.91 
 
 
695 aa  590  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  42.84 
 
 
692 aa  587  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  44.44 
 
 
701 aa  585  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  41.89 
 
 
695 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  45.07 
 
 
680 aa  575  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  43.04 
 
 
692 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  41.16 
 
 
696 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  40.84 
 
 
696 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  41.02 
 
 
697 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  42.82 
 
 
692 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  42.59 
 
 
692 aa  562  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  41.02 
 
 
697 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.38 
 
 
682 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  41.02 
 
 
697 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  41.69 
 
 
697 aa  561  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  41.24 
 
 
697 aa  559  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  42.73 
 
 
691 aa  555  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  41.92 
 
 
692 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  41.98 
 
 
692 aa  556  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  42.11 
 
 
694 aa  558  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  42.11 
 
 
667 aa  554  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  40.38 
 
 
691 aa  555  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  42.69 
 
 
691 aa  553  1e-156  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  42.1 
 
 
673 aa  552  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  41.46 
 
 
689 aa  553  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  42.13 
 
 
692 aa  555  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  41.2 
 
 
689 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  40.58 
 
 
697 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  41.81 
 
 
700 aa  548  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  40.99 
 
 
692 aa  546  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  41.13 
 
 
692 aa  548  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  41.13 
 
 
692 aa  548  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  40.99 
 
 
692 aa  547  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  41.25 
 
 
692 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  40.99 
 
 
692 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  41.13 
 
 
692 aa  548  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  41.38 
 
 
700 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  41.92 
 
 
691 aa  547  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  41.98 
 
 
692 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  40.99 
 
 
692 aa  546  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  40.7 
 
 
692 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  40.99 
 
 
692 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  42.63 
 
 
682 aa  548  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  41.12 
 
 
689 aa  542  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  40.7 
 
 
692 aa  542  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  39.91 
 
 
691 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  40.84 
 
 
692 aa  545  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  41.52 
 
 
700 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  41.3 
 
 
699 aa  543  1e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  41.3 
 
 
699 aa  542  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  41.07 
 
 
692 aa  542  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  39.91 
 
 
691 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  40.2 
 
 
691 aa  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  40.44 
 
 
691 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  40.29 
 
 
691 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  40.29 
 
 
691 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  40.32 
 
 
693 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  40.93 
 
 
692 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  41.55 
 
 
692 aa  542  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  40.23 
 
 
695 aa  535  1e-151  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  43.98 
 
 
694 aa  536  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  40.7 
 
 
692 aa  538  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  40.68 
 
 
691 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  40.68 
 
 
691 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  40 
 
 
692 aa  537  1e-151  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  41.69 
 
 
692 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  40.66 
 
 
700 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  40.03 
 
 
691 aa  533  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  41.38 
 
 
673 aa  533  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  40.06 
 
 
692 aa  534  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  40.52 
 
 
701 aa  532  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  41.34 
 
 
707 aa  533  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  40.15 
 
 
692 aa  528  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  39.13 
 
 
696 aa  531  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  40.14 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  40.14 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  39.42 
 
 
697 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  39.86 
 
 
698 aa  530  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3749  elongation factor G  40.14 
 
 
700 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00154253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>