More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4111 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  100 
 
 
697 aa  1416    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  44.8 
 
 
688 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  42.2 
 
 
691 aa  554  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  40.49 
 
 
695 aa  539  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  42.44 
 
 
686 aa  538  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  41.57 
 
 
687 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  39.29 
 
 
694 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  39.43 
 
 
694 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  39.13 
 
 
701 aa  521  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  39.53 
 
 
679 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  41.8 
 
 
685 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  43.36 
 
 
688 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  38.46 
 
 
692 aa  516  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  38.51 
 
 
696 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  38.36 
 
 
696 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  41.27 
 
 
686 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  41.62 
 
 
691 aa  514  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  42.35 
 
 
680 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  39.47 
 
 
696 aa  510  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  40.23 
 
 
701 aa  511  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  39.57 
 
 
701 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  38.08 
 
 
695 aa  509  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  38.01 
 
 
697 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  40.51 
 
 
692 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  39.43 
 
 
670 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  38.4 
 
 
673 aa  490  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  37.86 
 
 
697 aa  492  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  37.2 
 
 
694 aa  489  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  39.36 
 
 
685 aa  486  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  37.24 
 
 
691 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  37.93 
 
 
696 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.4 
 
 
682 aa  487  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  39.77 
 
 
707 aa  488  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  38.4 
 
 
697 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  37.34 
 
 
673 aa  482  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  39.42 
 
 
690 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  37.43 
 
 
693 aa  482  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  37.84 
 
 
704 aa  475  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  39.83 
 
 
701 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  38.36 
 
 
683 aa  477  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  36.72 
 
 
697 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  38.32 
 
 
685 aa  473  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  38.48 
 
 
692 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  37.3 
 
 
689 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  36.74 
 
 
692 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  37.74 
 
 
692 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  37.18 
 
 
692 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  37.32 
 
 
692 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  37.12 
 
 
692 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  37.03 
 
 
692 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  39.69 
 
 
701 aa  472  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  37.3 
 
 
688 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  37.12 
 
 
695 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  37.03 
 
 
692 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  37.03 
 
 
692 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  37.18 
 
 
692 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  36.89 
 
 
692 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  37.17 
 
 
691 aa  467  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  37.03 
 
 
692 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  38.07 
 
 
683 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  37.57 
 
 
691 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  37.83 
 
 
691 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  38.02 
 
 
692 aa  468  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  36.21 
 
 
699 aa  467  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  37.03 
 
 
692 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  37.57 
 
 
691 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  36.28 
 
 
689 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  37.16 
 
 
692 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  35.85 
 
 
697 aa  463  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  38.05 
 
 
667 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  36.6 
 
 
692 aa  465  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  36.96 
 
 
693 aa  462  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  35.64 
 
 
683 aa  462  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  37.08 
 
 
691 aa  464  1e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  36.74 
 
 
692 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  36.87 
 
 
691 aa  460  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  36.61 
 
 
698 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  36.96 
 
 
699 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  36.99 
 
 
695 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  36.96 
 
 
699 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  39.59 
 
 
677 aa  461  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  37.99 
 
 
691 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  36.38 
 
 
682 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  37 
 
 
692 aa  456  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  36.14 
 
 
689 aa  458  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  36.3 
 
 
704 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2618  elongation factor G-like  40.7 
 
 
693 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  36.43 
 
 
692 aa  458  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  37.1 
 
 
698 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  36.61 
 
 
698 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  36.6 
 
 
698 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1117  elongation factor G  37.1 
 
 
698 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2585  elongation factor G domain-containing protein  41.11 
 
 
694 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.259754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  38.41 
 
 
703 aa  458  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  37.09 
 
 
700 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  35.95 
 
 
692 aa  455  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  36.94 
 
 
698 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3807  elongation factor G  36.94 
 
 
700 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3749  elongation factor G  36.94 
 
 
700 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00154253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3475  elongation factor G  36.94 
 
 
700 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0181695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>