More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1541 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  63.86 
 
 
683 aa  895    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  71.43 
 
 
685 aa  1010    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0879  small GTP-binding protein  53.02 
 
 
690 aa  726    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.323736  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  100 
 
 
685 aa  1383    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  63.72 
 
 
683 aa  879    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  44.77 
 
 
695 aa  623  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  43.31 
 
 
694 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  44.43 
 
 
696 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  41.02 
 
 
696 aa  570  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  43.09 
 
 
679 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  43.99 
 
 
691 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  41.7 
 
 
695 aa  560  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  41.3 
 
 
692 aa  552  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  41.46 
 
 
696 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  41.46 
 
 
696 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  43.21 
 
 
680 aa  548  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  43.83 
 
 
695 aa  545  1e-154  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  42.35 
 
 
691 aa  548  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  41.91 
 
 
691 aa  542  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  42.04 
 
 
697 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  42.94 
 
 
689 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  41.79 
 
 
688 aa  538  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  42.4 
 
 
692 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  42.02 
 
 
693 aa  533  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  41.96 
 
 
691 aa  534  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  42.08 
 
 
670 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  42.14 
 
 
692 aa  529  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  42.21 
 
 
689 aa  529  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  42.52 
 
 
692 aa  531  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  42.58 
 
 
689 aa  527  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  41.81 
 
 
692 aa  527  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  41.06 
 
 
697 aa  528  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  41.69 
 
 
694 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  41.48 
 
 
691 aa  525  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  40.15 
 
 
693 aa  524  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  41.08 
 
 
692 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  41.08 
 
 
692 aa  523  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  41.08 
 
 
692 aa  523  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  39.88 
 
 
692 aa  525  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  40.12 
 
 
673 aa  524  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  41.96 
 
 
692 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  40.59 
 
 
701 aa  525  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  41.67 
 
 
692 aa  523  1e-147  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.36 
 
 
682 aa  522  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  40.94 
 
 
692 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  40.65 
 
 
694 aa  524  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  40.88 
 
 
701 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  40.79 
 
 
692 aa  519  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  42.39 
 
 
692 aa  521  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  40.94 
 
 
692 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  40.94 
 
 
692 aa  521  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  40.64 
 
 
692 aa  519  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  40.94 
 
 
692 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  42.32 
 
 
692 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  41.79 
 
 
691 aa  520  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  40.5 
 
 
694 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  40.64 
 
 
692 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  43.89 
 
 
701 aa  519  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  40.38 
 
 
691 aa  520  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1314  elongation factor G  41.97 
 
 
702 aa  521  1e-146  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00915512  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  43.4 
 
 
698 aa  521  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  41.65 
 
 
693 aa  521  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  39.47 
 
 
690 aa  520  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  42.92 
 
 
691 aa  520  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  44.37 
 
 
701 aa  519  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  41.73 
 
 
692 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  43.63 
 
 
694 aa  518  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  43.63 
 
 
694 aa  518  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  42.77 
 
 
692 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  41.59 
 
 
691 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  42.23 
 
 
692 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  40.29 
 
 
706 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  42.41 
 
 
691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  40.79 
 
 
692 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  44.68 
 
 
695 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  40.62 
 
 
692 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  40.53 
 
 
691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  42.2 
 
 
691 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0584  elongation factor G  43.33 
 
 
693 aa  515  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768044  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0570  elongation factor G  43.33 
 
 
693 aa  515  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  42.68 
 
 
696 aa  515  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  42.72 
 
 
688 aa  514  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  42.14 
 
 
691 aa  513  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  39.85 
 
 
691 aa  514  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  42.2 
 
 
691 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  42.2 
 
 
691 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  43.1 
 
 
697 aa  514  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  42.83 
 
 
698 aa  509  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  39.94 
 
 
689 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  41.92 
 
 
692 aa  510  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  42.48 
 
 
692 aa  511  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  40.56 
 
 
691 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  42.68 
 
 
698 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  45 
 
 
715 aa  509  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  40.56 
 
 
691 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  41.23 
 
 
692 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  39.18 
 
 
697 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  39.68 
 
 
701 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  42.37 
 
 
698 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  42.3 
 
 
692 aa  508  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>