More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0222 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  75.84 
 
 
690 aa  1133    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  81.51 
 
 
691 aa  1224    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  77.94 
 
 
690 aa  1163    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  75.76 
 
 
691 aa  1146    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  75.91 
 
 
693 aa  1138    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  80.7 
 
 
691 aa  1203    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  100 
 
 
691 aa  1426    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  44.33 
 
 
695 aa  615  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  42.11 
 
 
707 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  41.62 
 
 
692 aa  577  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  39.88 
 
 
695 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  42.4 
 
 
679 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  42.15 
 
 
694 aa  549  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  40.84 
 
 
699 aa  551  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  39.28 
 
 
694 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  39.74 
 
 
697 aa  547  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7102  elongation factor G  39.97 
 
 
710 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  40.38 
 
 
697 aa  548  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  40.23 
 
 
694 aa  545  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  38.29 
 
 
696 aa  538  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  38.76 
 
 
691 aa  538  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  40.03 
 
 
673 aa  536  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  38.1 
 
 
694 aa  535  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  39.74 
 
 
692 aa  531  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  37.97 
 
 
696 aa  530  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  39.8 
 
 
696 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  39.8 
 
 
696 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  38.03 
 
 
701 aa  528  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  39.77 
 
 
697 aa  528  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  38.27 
 
 
689 aa  522  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  38.26 
 
 
688 aa  521  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  38.35 
 
 
692 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  39.71 
 
 
680 aa  518  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  37.79 
 
 
697 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  38.49 
 
 
701 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  38.79 
 
 
673 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  38.39 
 
 
682 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  38.45 
 
 
691 aa  513  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  38.27 
 
 
692 aa  509  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  37.73 
 
 
699 aa  506  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  38.76 
 
 
667 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  38.15 
 
 
670 aa  505  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  37.12 
 
 
692 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  39.12 
 
 
682 aa  504  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  37.59 
 
 
699 aa  505  1e-141  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  37.63 
 
 
691 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  38.17 
 
 
691 aa  499  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  37.63 
 
 
691 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  37.77 
 
 
691 aa  501  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  37.24 
 
 
691 aa  500  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  37.37 
 
 
692 aa  502  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  37.34 
 
 
691 aa  499  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  36.55 
 
 
701 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  36.51 
 
 
697 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  36.75 
 
 
691 aa  495  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  37.13 
 
 
692 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  37.12 
 
 
693 aa  497  1e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  37.3 
 
 
697 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  37.19 
 
 
697 aa  498  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  37.25 
 
 
697 aa  498  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0933  elongation factor G  36.03 
 
 
719 aa  493  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.246025 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  36.73 
 
 
692 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  35.87 
 
 
692 aa  495  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  36.73 
 
 
692 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  36.73 
 
 
692 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  36.73 
 
 
692 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  36.58 
 
 
692 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  36.73 
 
 
692 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  37.17 
 
 
691 aa  494  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  36.73 
 
 
692 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  36.99 
 
 
701 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  38.42 
 
 
691 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  36.56 
 
 
701 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  37.02 
 
 
689 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  36.73 
 
 
692 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  36.16 
 
 
693 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  36.73 
 
 
692 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  37.19 
 
 
692 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  36.62 
 
 
691 aa  489  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  37.48 
 
 
703 aa  490  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  36.43 
 
 
692 aa  492  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  36.64 
 
 
692 aa  490  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  37.17 
 
 
691 aa  489  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  35.92 
 
 
698 aa  490  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  36.21 
 
 
698 aa  490  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  35.51 
 
 
686 aa  486  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  36.68 
 
 
692 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  35.42 
 
 
693 aa  487  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  36.15 
 
 
698 aa  488  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  35.61 
 
 
683 aa  486  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  36.9 
 
 
692 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  36.99 
 
 
689 aa  488  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  37.04 
 
 
692 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  36.67 
 
 
694 aa  487  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  36.09 
 
 
683 aa  488  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  36.43 
 
 
698 aa  488  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000344622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  37.63 
 
 
704 aa  483  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  36.51 
 
 
697 aa  484  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  36.9 
 
 
692 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  35.49 
 
 
698 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>