More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_995 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1212  elongation factor G  96.63 
 
 		 686 aa  1344    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  100 
 
 		 683 aa  1400    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  91.79 
 
 		 683 aa  1301    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  46.18 
 
 		 695 aa  641    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  47.61 
 
 		 696 aa  674    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  51.33 
 
 		 680 aa  694    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  46.82 
 
 		 692 aa  671    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  48 
 
 		 679 aa  674    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  47.24 
 
 		 695 aa  663    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  43.23 
 
 		 694 aa  628  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  45.56 
 
 		 696 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  45.56 
 
 		 696 aa  631  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  47.76 
 
 		 682 aa  631  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  46.18 
 
 		 673 aa  624  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  47.49 
 
 		 691 aa  624  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  44.83 
 
 		 697 aa  619  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  44.53 
 
 		 670 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  45.86 
 
 		 701 aa  615  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  46.35 
 
 		 694 aa  615  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  46.29 
 
 		 694 aa  617  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  47.43 
 
 		 673 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  46.19 
 
 		 690 aa  611  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  46.3 
 
 		 701 aa  610  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  43.78 
 
 		 667 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  43.6 
 
 		 697 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  44.54 
 
 		 691 aa  597  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  44.7 
 
 		 703 aa  593  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  45.32 
 
 		 701 aa  592  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  45.12 
 
 		 694 aa  595  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  44.49 
 
 		 697 aa  588  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  42.96 
 
 		 697 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  44.43 
 
 		 703 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  44.22 
 
 		 697 aa  581  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  43.95 
 
 		 696 aa  580  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  44.06 
 
 		 692 aa  579  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  43.19 
 
 		 692 aa  582  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  44.18 
 
 		 689 aa  580  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  43.09 
 
 		 682 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  44.86 
 
 		 701 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  43.24 
 
 		 691 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  42.67 
 
 		 692 aa  573  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  43.07 
 
 		 689 aa  575  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  42.58 
 
 		 689 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  42.79 
 
 		 692 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  43 
 
 		 692 aa  572  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  42.79 
 
 		 692 aa  569  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  44.46 
 
 		 691 aa  570  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  42.94 
 
 		 692 aa  570  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  42.79 
 
 		 692 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  42.71 
 
 		 692 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  42.79 
 
 		 692 aa  568  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  42.5 
 
 		 692 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  42.5 
 
 		 692 aa  565  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  42.5 
 
 		 692 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  42.35 
 
 		 692 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  42.79 
 
 		 692 aa  567  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  42.5 
 
 		 692 aa  566  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  41.97 
 
 		 692 aa  567  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  43.15 
 
 		 691 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  41.78 
 
 		 692 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  42.65 
 
 		 691 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  43.02 
 
 		 691 aa  564  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  42.35 
 
 		 692 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  41.55 
 
 		 688 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  41.76 
 
 		 701 aa  561  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  41.8 
 
 		 697 aa  560  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  43.57 
 
 		 695 aa  560  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  42.05 
 
 		 701 aa  560  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  41.41 
 
 		 692 aa  559  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  43.57 
 
 		 695 aa  560  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  42.22 
 
 		 701 aa  559  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  41.61 
 
 		 704 aa  558  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  42.06 
 
 		 697 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  43.66 
 
 		 690 aa  557  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  41.18 
 
 		 697 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  41.87 
 
 		 692 aa  558  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  41.06 
 
 		 691 aa  552  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  41.95 
 
 		 691 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  41.58 
 
 		 691 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  41.41 
 
 		 691 aa  555  1e-156  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  41.58 
 
 		 691 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  41.06 
 
 		 691 aa  552  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  41.95 
 
 		 691 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  41.43 
 
 		 691 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  41.79 
 
 		 698 aa  553  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  41.56 
 
 		 693 aa  548  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  41.68 
 
 		 702 aa  548  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  41.7 
 
 		 692 aa  551  1e-155  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  41.09 
 
 		 692 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  41.29 
 
 		 691 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  41.24 
 
 		 692 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  40.91 
 
 		 691 aa  551  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  42.01 
 
 		 703 aa  548  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  41.38 
 
 		 704 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  40.59 
 
 		 697 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  42.75 
 
 		 696 aa  551  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  40.74 
 
 		 697 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  41.87 
 
 		 691 aa  551  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  40.47 
 
 		 692 aa  551  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  42.48 
 
 		 692 aa  545  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>