More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2098 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2121  small GTP-binding protein  78.81 
 
 
658 aa  991    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  100 
 
 
656 aa  1325    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  44.89 
 
 
677 aa  548  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  39.74 
 
 
695 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  39.97 
 
 
694 aa  534  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  40.45 
 
 
679 aa  525  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  40 
 
 
695 aa  526  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  40.57 
 
 
696 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  38.47 
 
 
696 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  38.33 
 
 
696 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  39.35 
 
 
696 aa  511  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  41.73 
 
 
680 aa  507  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  39.58 
 
 
673 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  39.31 
 
 
682 aa  499  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  39.52 
 
 
670 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  40.62 
 
 
682 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  39.12 
 
 
673 aa  490  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  38.36 
 
 
691 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  39.82 
 
 
690 aa  487  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  38.35 
 
 
692 aa  484  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  38.63 
 
 
667 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  38 
 
 
701 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  38.36 
 
 
686 aa  473  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  38.01 
 
 
694 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  40.03 
 
 
697 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  37.01 
 
 
683 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  39.3 
 
 
691 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  37.67 
 
 
683 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  37.37 
 
 
701 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  37.85 
 
 
701 aa  465  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  37.59 
 
 
691 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  37.85 
 
 
691 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  37.85 
 
 
691 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  38.88 
 
 
683 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  38.86 
 
 
685 aa  459  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  36.99 
 
 
694 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  38.76 
 
 
686 aa  458  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  36.23 
 
 
697 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  35.59 
 
 
688 aa  459  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  38.17 
 
 
701 aa  455  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  37.5 
 
 
694 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  36.47 
 
 
692 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  36.97 
 
 
689 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  37.35 
 
 
692 aa  450  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  35.82 
 
 
697 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  38.38 
 
 
686 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  38.73 
 
 
695 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  39.31 
 
 
701 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  38.73 
 
 
695 aa  451  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  37.24 
 
 
690 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  36.75 
 
 
691 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  34.94 
 
 
693 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  36.23 
 
 
688 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  36.75 
 
 
685 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0793  translation elongation factor G  36.31 
 
 
695 aa  446  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  37.89 
 
 
692 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  36.22 
 
 
691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  34.94 
 
 
692 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  36.02 
 
 
691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  35.42 
 
 
699 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  35.49 
 
 
695 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  35.67 
 
 
691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  36.11 
 
 
697 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  36.4 
 
 
697 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  37.1 
 
 
691 aa  445  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0237  elongation factor G  36.6 
 
 
705 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000318631  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  34.65 
 
 
691 aa  442  1e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  35.28 
 
 
699 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0879  small GTP-binding protein  36.63 
 
 
690 aa  440  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.323736  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2404  small GTP-binding protein  37.48 
 
 
718 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136608  normal  0.0116105 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  35.87 
 
 
691 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  36.56 
 
 
697 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  35.87 
 
 
691 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  35.87 
 
 
691 aa  442  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  35.44 
 
 
691 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  36.31 
 
 
691 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  38.29 
 
 
683 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  38.94 
 
 
703 aa  440  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  38.4 
 
 
688 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  37.33 
 
 
681 aa  436  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  36.07 
 
 
692 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.85 
 
 
682 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  36.67 
 
 
691 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  35.18 
 
 
692 aa  437  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  35.58 
 
 
691 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  35.94 
 
 
692 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  35.04 
 
 
690 aa  432  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  35.24 
 
 
692 aa  435  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  35.44 
 
 
692 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  35.44 
 
 
692 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  35.32 
 
 
694 aa  435  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  35.32 
 
 
694 aa  435  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  36.08 
 
 
692 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  35.44 
 
 
692 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  35.29 
 
 
692 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  36.03 
 
 
689 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  35.54 
 
 
692 aa  435  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  34.25 
 
 
699 aa  433  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  36.38 
 
 
691 aa  434  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  34.25 
 
 
699 aa  433  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>