More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2879 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.91 
 
 		 692 aa  691    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  47.25 
 
 		 701 aa  640    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  52.04 
 
 		 670 aa  709    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  47.68 
 
 		 673 aa  662    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  46.72 
 
 		 696 aa  675    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  100 
 
 		 694 aa  1422    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  57.56 
 
 		 679 aa  806    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  50.51 
 
 		 680 aa  704    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  47.11 
 
 		 701 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  48.12 
 
 		 694 aa  659    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  51.74 
 
 		 696 aa  732    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  48.53 
 
 		 682 aa  658    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  51.3 
 
 		 696 aa  727    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  49.34 
 
 		 673 aa  669    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  50.66 
 
 		 682 aa  687    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  57.06 
 
 		 694 aa  843    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  70.95 
 
 		 695 aa  1027    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  47.3 
 
 		 691 aa  643    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  48.48 
 
 		 697 aa  690    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  46.35 
 
 		 697 aa  640    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  46.44 
 
 		 694 aa  637    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  50.07 
 
 		 667 aa  672    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  47.18 
 
 		 697 aa  632  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  46.45 
 
 		 697 aa  633  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  46.66 
 
 		 692 aa  629  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  45.04 
 
 		 693 aa  625  1e-178  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  46.01 
 
 		 692 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  45.51 
 
 		 691 aa  624  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  45.26 
 
 		 695 aa  620  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  45.71 
 
 		 689 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  46.29 
 
 		 689 aa  617  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  45.14 
 
 		 691 aa  612  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  43.91 
 
 		 691 aa  613  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  44.04 
 
 		 683 aa  614  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  43.95 
 
 		 692 aa  610  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  45.63 
 
 		 691 aa  610  1e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  44.56 
 
 		 692 aa  609  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  44.4 
 
 		 692 aa  606  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  45.22 
 
 		 692 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  44.41 
 
 		 692 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  44.56 
 
 		 692 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  44.56 
 
 		 692 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  44.41 
 
 		 692 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  44.27 
 
 		 692 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  44.56 
 
 		 692 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  44.56 
 
 		 692 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  44.27 
 
 		 692 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  44.41 
 
 		 692 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  44.12 
 
 		 692 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  44.4 
 
 		 691 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  44.4 
 
 		 691 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  44.06 
 
 		 692 aa  599  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  44.19 
 
 		 691 aa  601  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  45.02 
 
 		 697 aa  599  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  45.12 
 
 		 692 aa  598  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  44.98 
 
 		 692 aa  599  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  45.56 
 
 		 686 aa  595  1e-169  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  43.21 
 
 		 697 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  43.77 
 
 		 692 aa  595  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17210  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  44.48 
 
 		 704 aa  597  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.803551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  43.07 
 
 		 697 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  43.07 
 
 		 697 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  44.9 
 
 		 689 aa  598  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  45.28 
 
 		 692 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  44.75 
 
 		 688 aa  596  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  42.32 
 
 		 693 aa  593  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0709  elongation factor G  43.94 
 
 		 706 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  44.95 
 
 		 683 aa  594  1e-168  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  43.64 
 
 		 691 aa  588  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  43.9 
 
 		 689 aa  589  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  42.94 
 
 		 697 aa  589  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2693  elongation factor G  42.75 
 
 		 704 aa  588  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170425 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  44.38 
 
 		 693 aa  588  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  42.8 
 
 		 694 aa  585  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  45.44 
 
 		 691 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  42.55 
 
 		 697 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  43.62 
 
 		 690 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  43.23 
 
 		 692 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  42.32 
 
 		 692 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  44.73 
 
 		 692 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  44.59 
 
 		 698 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  43.98 
 
 		 696 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2980  elongation factor G  42.04 
 
 		 713 aa  582  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  43.67 
 
 		 692 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  43.5 
 
 		 698 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  43.04 
 
 		 700 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  43.44 
 
 		 692 aa  581  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  43.48 
 
 		 691 aa  581  1e-164  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  42.98 
 
 		 700 aa  579  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  43.17 
 
 		 690 aa  579  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  42.11 
 
 		 691 aa  581  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  43.9 
 
 		 697 aa  582  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  43.48 
 
 		 691 aa  580  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  43.76 
 
 		 692 aa  579  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  42.75 
 
 		 699 aa  579  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  43.48 
 
 		 691 aa  581  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  43.13 
 
 		 691 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  42.42 
 
 		 693 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  42.73 
 
 		 696 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  42.46 
 
 		 700 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>