More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0879 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0879  small GTP-binding protein  100 
 
 
690 aa  1389    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.323736  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  54.59 
 
 
683 aa  737    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  53.92 
 
 
685 aa  746    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  52.83 
 
 
685 aa  733    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  54.15 
 
 
683 aa  743    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  42.26 
 
 
695 aa  566  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  41.27 
 
 
691 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  39.14 
 
 
695 aa  529  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  39.6 
 
 
692 aa  525  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  41.47 
 
 
692 aa  523  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  40.4 
 
 
697 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  38.9 
 
 
691 aa  522  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  39.85 
 
 
696 aa  514  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  40.52 
 
 
691 aa  512  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  39.83 
 
 
691 aa  514  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  37.97 
 
 
696 aa  514  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  39.22 
 
 
689 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  39.3 
 
 
695 aa  509  1e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  39.71 
 
 
695 aa  509  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  39.77 
 
 
688 aa  511  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  38.58 
 
 
673 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  39.01 
 
 
691 aa  502  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  39.01 
 
 
691 aa  502  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  39.18 
 
 
679 aa  504  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  39.01 
 
 
691 aa  502  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  39.19 
 
 
692 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  40.58 
 
 
690 aa  505  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  40.58 
 
 
693 aa  500  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  38.76 
 
 
692 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  38.9 
 
 
691 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  38.33 
 
 
692 aa  500  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  39.22 
 
 
689 aa  501  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  37.2 
 
 
701 aa  500  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  38.47 
 
 
692 aa  501  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  38.47 
 
 
692 aa  498  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  38.47 
 
 
692 aa  498  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  38.47 
 
 
692 aa  498  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  38.33 
 
 
692 aa  497  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  38.47 
 
 
692 aa  498  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  38.6 
 
 
691 aa  496  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  38.62 
 
 
692 aa  499  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  39.04 
 
 
692 aa  496  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  36.91 
 
 
701 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  37.74 
 
 
697 aa  495  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  38.33 
 
 
692 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  38 
 
 
696 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  38.14 
 
 
696 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  38.54 
 
 
692 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  38.9 
 
 
689 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  39.22 
 
 
692 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  38.04 
 
 
692 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  39.07 
 
 
693 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  38.03 
 
 
701 aa  492  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  38.54 
 
 
692 aa  492  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  37.61 
 
 
701 aa  491  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  38.46 
 
 
692 aa  491  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  39.45 
 
 
689 aa  492  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  38.12 
 
 
692 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  38.26 
 
 
692 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  38.83 
 
 
692 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  38.39 
 
 
691 aa  488  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  37.43 
 
 
694 aa  488  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0793  translation elongation factor G  37.77 
 
 
695 aa  488  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  39.25 
 
 
680 aa  487  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  38.63 
 
 
692 aa  486  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  35.47 
 
 
690 aa  487  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  38.89 
 
 
692 aa  487  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  37.99 
 
 
701 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  36.48 
 
 
686 aa  485  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  37.74 
 
 
692 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  38.19 
 
 
692 aa  483  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  37.27 
 
 
686 aa  479  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  36.4 
 
 
693 aa  479  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  36.77 
 
 
686 aa  482  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  37.14 
 
 
688 aa  481  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  36.6 
 
 
691 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  38.29 
 
 
694 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  38.29 
 
 
694 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  38.99 
 
 
695 aa  480  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  36.6 
 
 
691 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  37.88 
 
 
704 aa  480  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  35.54 
 
 
683 aa  481  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  38.15 
 
 
691 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  38.39 
 
 
697 aa  481  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2717  elongation factor G  38.52 
 
 
688 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  38.42 
 
 
693 aa  482  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  38.19 
 
 
691 aa  481  1e-134  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  39.18 
 
 
691 aa  478  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  37.16 
 
 
692 aa  477  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  38.31 
 
 
704 aa  476  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  36.98 
 
 
683 aa  477  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  36.99 
 
 
694 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2403  elongation factor G  38.52 
 
 
688 aa  479  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149937  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  38.84 
 
 
695 aa  479  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  38.45 
 
 
682 aa  477  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  36.46 
 
 
699 aa  474  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  37.66 
 
 
691 aa  474  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  35.65 
 
 
691 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0237  elongation factor G  37.82 
 
 
705 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000318631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  36.74 
 
 
694 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>