More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0086 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  49.93 
 
 		 696 aa  724    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  93.44 
 
 		 701 aa  1325    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  100 
 
 		 701 aa  1429    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  57.51 
 
 		 703 aa  845    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  44.7 
 
 		 695 aa  640    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  67.48 
 
 		 703 aa  978    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  45.17 
 
 		 695 aa  640    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  43.45 
 
 		 694 aa  643    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  43.99 
 
 		 679 aa  624  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  42.51 
 
 		 692 aa  621  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  42.63 
 
 		 696 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  42.63 
 
 		 696 aa  618  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  46.12 
 
 		 680 aa  612  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  43.67 
 
 		 701 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  42.32 
 
 		 691 aa  598  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  43.68 
 
 		 694 aa  596  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  44.86 
 
 		 683 aa  597  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  43.39 
 
 		 673 aa  594  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  41.82 
 
 		 697 aa  589  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  43.24 
 
 		 701 aa  589  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  42.61 
 
 		 670 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  43.87 
 
 		 694 aa  585  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  45.15 
 
 		 686 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  41.82 
 
 		 682 aa  585  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  41.37 
 
 		 673 aa  580  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  44.86 
 
 		 683 aa  582  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  42.33 
 
 		 697 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  41.52 
 
 		 694 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  41.37 
 
 		 667 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  43.04 
 
 		 690 aa  570  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  41.19 
 
 		 697 aa  567  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  42.94 
 
 		 698 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  41.68 
 
 		 696 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  42.01 
 
 		 692 aa  562  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  41.98 
 
 		 692 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  41.14 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  42.37 
 
 		 692 aa  559  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  42.4 
 
 		 692 aa  561  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  40.99 
 
 		 692 aa  557  1e-157  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  40.06 
 
 		 691 aa  557  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  42.51 
 
 		 706 aa  555  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  41.47 
 
 		 692 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  39.63 
 
 		 691 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  40.38 
 
 		 691 aa  550  1e-155  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  40.75 
 
 		 689 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  40.8 
 
 		 694 aa  546  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  40.8 
 
 		 694 aa  546  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  40.2 
 
 		 691 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  40.61 
 
 		 699 aa  546  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  40.14 
 
 		 697 aa  546  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  40.76 
 
 		 691 aa  547  1e-154  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  40.61 
 
 		 699 aa  545  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  39.77 
 
 		 691 aa  547  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  40.2 
 
 		 691 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  39.83 
 
 		 692 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  40.47 
 
 		 693 aa  544  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  40.56 
 
 		 692 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  40.58 
 
 		 697 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  41.02 
 
 		 692 aa  544  1e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  41.53 
 
 		 691 aa  543  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  39.8 
 
 		 691 aa  542  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  40.49 
 
 		 700 aa  542  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1940  elongation factor G  40.23 
 
 		 707 aa  541  9.999999999999999e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  40.35 
 
 		 692 aa  541  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  41.33 
 
 		 697 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  39.45 
 
 		 691 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  42.36 
 
 		 691 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  40.72 
 
 		 697 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  40.58 
 
 		 697 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  39.8 
 
 		 692 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  40.32 
 
 		 691 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  39.43 
 
 		 697 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  40.12 
 
 		 692 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  40.17 
 
 		 691 aa  538  1e-151  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  38.65 
 
 		 691 aa  538  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  40.87 
 
 		 704 aa  538  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  41.04 
 
 		 689 aa  535  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  39.33 
 
 		 692 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  40 
 
 		 691 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  41.27 
 
 		 692 aa  538  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  40.03 
 
 		 691 aa  536  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0709  elongation factor G  39.69 
 
 		 706 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  41.38 
 
 		 698 aa  536  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  40.67 
 
 		 691 aa  536  1e-151  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  41.99 
 
 		 688 aa  535  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  39.83 
 
 		 692 aa  532  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  40.75 
 
 		 692 aa  533  1e-150  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  40.29 
 
 		 697 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  40.49 
 
 		 699 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  39.45 
 
 		 704 aa  533  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  39.74 
 
 		 692 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  41.19 
 
 		 686 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  40.54 
 
 		 705 aa  535  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  39.94 
 
 		 697 aa  534  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  40.37 
 
 		 700 aa  535  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  41.13 
 
 		 690 aa  533  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  38.88 
 
 		 688 aa  534  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  40.49 
 
 		 699 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  40.06 
 
 		 689 aa  534  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  40.46 
 
 		 693 aa  533  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>