More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3749 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0222  elongation factor G  58.47 
 
 		 683 aa  813    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3749  elongation factor G  100 
 
 		 688 aa  1402    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.158222  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3402  elongation factor G  61.66 
 
 		 730 aa  840    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312369 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5542  elongation factor G  62.48 
 
 		 686 aa  833    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2225  elongation factor G  53.37 
 
 		 680 aa  758    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3719  elongation factor G  60.94 
 
 		 700 aa  809    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252538 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000680  translation elongation factor G-related protein  48.66 
 
 		 674 aa  681    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1382  elongation factor G  58.52 
 
 		 684 aa  802    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6425  elongation factor G  78.69 
 
 		 681 aa  1130    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2663  elongation factor G  48.25 
 
 		 682 aa  669    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1266  elongation factor G  53.57 
 
 		 684 aa  711    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.782059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3200  elongation factor G  49.48 
 
 		 682 aa  659    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1118  elongation factor G  50 
 
 		 682 aa  669    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4182  elongation factor G  61.41 
 
 		 686 aa  816    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  39.06 
 
 		 695 aa  504  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  36.98 
 
 		 691 aa  472  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  35.01 
 
 		 688 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  37.64 
 
 		 690 aa  460  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  35.58 
 
 		 685 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  35.67 
 
 		 696 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  34.44 
 
 		 679 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  35.1 
 
 		 696 aa  437  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  36.63 
 
 		 683 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  33.67 
 
 		 692 aa  433  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  35.84 
 
 		 687 aa  429  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  36.07 
 
 		 686 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  36.96 
 
 		 656 aa  429  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  36.13 
 
 		 680 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  37.16 
 
 		 683 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  34.78 
 
 		 682 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  33.81 
 
 		 696 aa  423  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  34.36 
 
 		 682 aa  424  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  35.78 
 
 		 685 aa  419  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  34.88 
 
 		 701 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  35.12 
 
 		 707 aa  422  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  35.86 
 
 		 701 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  34.6 
 
 		 701 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  34.11 
 
 		 683 aa  420  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  35.19 
 
 		 699 aa  419  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  32.61 
 
 		 696 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  33.19 
 
 		 695 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0879  small GTP-binding protein  33.43 
 
 		 690 aa  413  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.323736  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  32.56 
 
 		 696 aa  416  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  34.24 
 
 		 673 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  35.65 
 
 		 688 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  34.24 
 
 		 691 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  34.05 
 
 		 670 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  34.8 
 
 		 690 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  37.48 
 
 		 677 aa  408  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  36.17 
 
 		 708 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  33.14 
 
 		 683 aa  405  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0933  elongation factor G  33.56 
 
 		 719 aa  404  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.246025 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  32.23 
 
 		 694 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  34.62 
 
 		 694 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  33.82 
 
 		 690 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  33.77 
 
 		 701 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0793  translation elongation factor G  33.19 
 
 		 695 aa  403  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  34.72 
 
 		 691 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  35.01 
 
 		 697 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  33.19 
 
 		 703 aa  401  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.56 
 
 		 682 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  34.65 
 
 		 703 aa  401  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  34.69 
 
 		 719 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  33.38 
 
 		 694 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  35.34 
 
 		 686 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  33.43 
 
 		 691 aa  396  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  33.04 
 
 		 692 aa  399  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  34.01 
 
 		 691 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  33.67 
 
 		 692 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  32.63 
 
 		 697 aa  393  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  35.29 
 
 		 691 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  33.52 
 
 		 706 aa  395  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  33.62 
 
 		 701 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  35.08 
 
 		 673 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  33.57 
 
 		 692 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  33.8 
 
 		 692 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  33.38 
 
 		 693 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  35.95 
 
 		 692 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  33.86 
 
 		 691 aa  392  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  35.35 
 
 		 719 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  33.67 
 
 		 692 aa  392  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  31.86 
 
 		 692 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  33.76 
 
 		 691 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0059  small GTP-binding protein  35.8 
 
 		 691 aa  389  1e-107  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  33.48 
 
 		 691 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  35.04 
 
 		 688 aa  389  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  32.9 
 
 		 692 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  35.41 
 
 		 697 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  32.36 
 
 		 693 aa  390  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  34.4 
 
 		 691 aa  392  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  33.19 
 
 		 697 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  34.47 
 
 		 704 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  35.31 
 
 		 685 aa  388  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  35.63 
 
 		 714 aa  388  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  33.62 
 
 		 691 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  33.04 
 
 		 697 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  35.46 
 
 		 690 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  32.5 
 
 		 667 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  33.86 
 
 		 692 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  35.67 
 
 		 701 aa  388  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>