More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4599 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0290  small GTP-binding protein  52.27 
 
 		 770 aa  664    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2404  small GTP-binding protein  55.9 
 
 		 718 aa  766    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136608  normal  0.0116105 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5225  elongation factor G  67.81 
 
 		 713 aa  917    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.526168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2340  elongation factor G  58.58 
 
 		 729 aa  785    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.468158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  66.95 
 
 		 714 aa  912    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  60.5 
 
 		 719 aa  838    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5517  elongation factor G  67.81 
 
 		 713 aa  917    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.469673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2732  small GTP-binding protein  57.97 
 
 		 696 aa  696    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556066  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  61.2 
 
 		 708 aa  863    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6127  elongation factor G  61.62 
 
 		 710 aa  825    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220969  normal  0.933466 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1361  elongation factor G  54.14 
 
 		 722 aa  712    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3802  elongation factor G  56.09 
 
 		 729 aa  748    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.812471  normal  0.705979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5155  elongation factor G  56.23 
 
 		 674 aa  688    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212266  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  57.78 
 
 		 717 aa  776    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0872  elongation factor G  56.14 
 
 		 722 aa  724    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5136  elongation factor G  67.81 
 
 		 713 aa  917    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674006  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2028  elongation factor G  56.21 
 
 		 726 aa  731    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521312  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  61.78 
 
 		 719 aa  843    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  100 
 
 		 701 aa  1404    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  58.22 
 
 		 717 aa  769    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2107  elongation factor G  59.68 
 
 		 741 aa  575  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000230841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  38.85 
 
 		 695 aa  494  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  36.31 
 
 		 692 aa  476  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  37.36 
 
 		 696 aa  477  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  38.12 
 
 		 679 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  37.13 
 
 		 695 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  36.74 
 
 		 694 aa  462  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  37.45 
 
 		 696 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  37.64 
 
 		 686 aa  451  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  37.07 
 
 		 683 aa  450  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  37.11 
 
 		 683 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.42 
 
 		 682 aa  443  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  35.93 
 
 		 682 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  37.95 
 
 		 680 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  34.53 
 
 		 696 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  36.38 
 
 		 667 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  39.6 
 
 		 688 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  36.96 
 
 		 673 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  34.67 
 
 		 696 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3227  small GTP-binding protein  42.76 
 
 		 683 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.717315  normal  0.0158872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  35.42 
 
 		 697 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  36.56 
 
 		 691 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  35.36 
 
 		 670 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  38.75 
 
 		 690 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  36.18 
 
 		 690 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  37.48 
 
 		 686 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  39.8 
 
 		 687 aa  430  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  35.68 
 
 		 691 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  36.68 
 
 		 692 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  34.59 
 
 		 682 aa  424  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  35.46 
 
 		 673 aa  423  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  37.48 
 
 		 686 aa  426  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  35.19 
 
 		 694 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  38.89 
 
 		 677 aa  421  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  36.12 
 
 		 689 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  34.14 
 
 		 697 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  36.11 
 
 		 703 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  34.9 
 
 		 693 aa  414  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  34.33 
 
 		 691 aa  416  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  34.38 
 
 		 692 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  34.29 
 
 		 693 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  34.2 
 
 		 697 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  34.5 
 
 		 688 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  36.42 
 
 		 685 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  34.05 
 
 		 693 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  33.43 
 
 		 697 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  33.99 
 
 		 697 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  36.62 
 
 		 701 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  33.67 
 
 		 701 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  34.66 
 
 		 692 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  34.84 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  34.72 
 
 		 689 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  33.95 
 
 		 691 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  34.19 
 
 		 692 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  33.91 
 
 		 693 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  34.91 
 
 		 691 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  36.09 
 
 		 687 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2225  elongation factor G  37.2 
 
 		 680 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  33.91 
 
 		 692 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  34.91 
 
 		 691 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  37.14 
 
 		 701 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  33.52 
 
 		 701 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  37.29 
 
 		 699 aa  402  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  33.66 
 
 		 692 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  34.91 
 
 		 691 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  34.05 
 
 		 695 aa  402  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  34.82 
 
 		 693 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  34.39 
 
 		 694 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  34.43 
 
 		 694 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  34.58 
 
 		 692 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  34.96 
 
 		 692 aa  398  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  36.8 
 
 		 691 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0584  elongation factor G  33.48 
 
 		 693 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768044  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  33.38 
 
 		 692 aa  397  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  34.24 
 
 		 692 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  34.18 
 
 		 697 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  34.29 
 
 		 697 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  34.58 
 
 		 687 aa  398  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  34.94 
 
 		 691 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  33.76 
 
 		 698 aa  396  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>