More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3227 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  66.13 
 
 		 687 aa  858    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3227  small GTP-binding protein  100 
 
 		 683 aa  1323    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.717315  normal  0.0158872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2043  small GTP-binding protein  58.05 
 
 		 687 aa  685    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.713225  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  40.03 
 
 		 695 aa  521  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  38.59 
 
 		 692 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  39.18 
 
 		 679 aa  511  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  39.74 
 
 		 696 aa  501  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  38.62 
 
 		 682 aa  497  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  37.66 
 
 		 694 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  37.44 
 
 		 691 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  40.85 
 
 		 683 aa  486  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  41.38 
 
 		 696 aa  482  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  40.29 
 
 		 680 aa  478  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  36.52 
 
 		 695 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  37.92 
 
 		 697 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  39.41 
 
 		 686 aa  464  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  39.14 
 
 		 691 aa  462  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  36.64 
 
 		 688 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  39.02 
 
 		 703 aa  465  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  38.96 
 
 		 683 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  42.76 
 
 		 701 aa  463  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  36.83 
 
 		 694 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  40.84 
 
 		 708 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  41 
 
 		 690 aa  461  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  37.46 
 
 		 673 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  37.3 
 
 		 697 aa  458  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  36.28 
 
 		 701 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  34.6 
 
 		 696 aa  458  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  34.31 
 
 		 696 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  40.69 
 
 		 719 aa  457  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  37.34 
 
 		 694 aa  459  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  35.99 
 
 		 701 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  36.94 
 
 		 703 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  40.63 
 
 		 719 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  35.07 
 
 		 682 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  37.32 
 
 		 673 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  35.8 
 
 		 697 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  36.95 
 
 		 670 aa  452  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  43.11 
 
 		 677 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  37.39 
 
 		 694 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  38.78 
 
 		 701 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  38.91 
 
 		 686 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  38.72 
 
 		 701 aa  443  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  36 
 
 		 667 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  39.21 
 
 		 687 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  36.38 
 
 		 692 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  36.99 
 
 		 707 aa  441  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  37.46 
 
 		 701 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  36.65 
 
 		 692 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  36.68 
 
 		 701 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.35 
 
 		 682 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6127  elongation factor G  41.41 
 
 		 710 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220969  normal  0.933466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  36.46 
 
 		 695 aa  434  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  36.46 
 
 		 701 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  36.32 
 
 		 691 aa  435  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  36.01 
 
 		 691 aa  432  1e-119  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  38.37 
 
 		 690 aa  432  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  35.27 
 
 		 692 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  36.61 
 
 		 692 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  36.01 
 
 		 691 aa  432  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  36.01 
 
 		 691 aa  431  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  36.9 
 
 		 697 aa  432  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  36.47 
 
 		 683 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  37.46 
 
 		 685 aa  431  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  35.16 
 
 		 691 aa  426  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  35.76 
 
 		 692 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  40.89 
 
 		 714 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  36.43 
 
 		 692 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  35.37 
 
 		 691 aa  427  1e-118  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  36.34 
 
 		 686 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  37.21 
 
 		 693 aa  426  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  34.84 
 
 		 692 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  35.69 
 
 		 692 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  35.82 
 
 		 697 aa  425  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  36.96 
 
 		 689 aa  426  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2404  small GTP-binding protein  38.89 
 
 		 718 aa  425  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136608  normal  0.0116105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2340  elongation factor G  39.77 
 
 		 729 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.468158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  36.24 
 
 		 704 aa  424  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  35.58 
 
 		 697 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  35.99 
 
 		 702 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  34.65 
 
 		 692 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  35.12 
 
 		 692 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  35.68 
 
 		 691 aa  419  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  35.52 
 
 		 704 aa  420  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  38.6 
 
 		 688 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  37.06 
 
 		 681 aa  421  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  36.09 
 
 		 685 aa  422  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  36.03 
 
 		 704 aa  419  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  34.11 
 
 		 691 aa  421  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  38.15 
 
 		 688 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  35.27 
 
 		 691 aa  421  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0237  elongation factor G  34.48 
 
 		 705 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000318631  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  34.95 
 
 		 691 aa  417  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  35.58 
 
 		 697 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3277  elongation factor G  36.85 
 
 		 701 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0394176  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  35.43 
 
 		 697 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  36.1 
 
 		 689 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2028  elongation factor G  41.8 
 
 		 726 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521312  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  34.93 
 
 		 698 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  34.93 
 
 		 698 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>