More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1361 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0872  elongation factor G  52.73 
 
 		 722 aa  665    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  57.68 
 
 		 719 aa  799    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  57.64 
 
 		 708 aa  786    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3802  elongation factor G  54.63 
 
 		 729 aa  698    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.812471  normal  0.705979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1361  elongation factor G  100 
 
 		 722 aa  1430    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2340  elongation factor G  58.06 
 
 		 729 aa  764    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.468158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  56.24 
 
 		 714 aa  731    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5517  elongation factor G  54.81 
 
 		 713 aa  703    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.469673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5136  elongation factor G  54.81 
 
 		 713 aa  703    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6127  elongation factor G  57.42 
 
 		 710 aa  764    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220969  normal  0.933466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  55.46 
 
 		 717 aa  715    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2732  small GTP-binding protein  55.49 
 
 		 696 aa  665    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2028  elongation factor G  52.85 
 
 		 726 aa  672    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521312  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  54.94 
 
 		 717 aa  703    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5155  elongation factor G  68.19 
 
 		 674 aa  855    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212266  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  57.1 
 
 		 719 aa  770    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2404  small GTP-binding protein  53 
 
 		 718 aa  698    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136608  normal  0.0116105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  54.14 
 
 		 701 aa  712    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5225  elongation factor G  54.81 
 
 		 713 aa  703    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.526168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0290  small GTP-binding protein  48.43 
 
 		 770 aa  592  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2107  elongation factor G  55.77 
 
 		 741 aa  521  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000230841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  38.15 
 
 		 695 aa  484  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  37.83 
 
 		 680 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  38.02 
 
 		 690 aa  444  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  34.92 
 
 		 670 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  36.8 
 
 		 696 aa  429  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  36.17 
 
 		 691 aa  430  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  36.05 
 
 		 673 aa  429  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  35.06 
 
 		 679 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  34.45 
 
 		 694 aa  422  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  35.85 
 
 		 673 aa  425  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  35.09 
 
 		 682 aa  421  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  35.64 
 
 		 692 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  34.31 
 
 		 695 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  39.35 
 
 		 677 aa  417  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  33.66 
 
 		 696 aa  413  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  35.12 
 
 		 701 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.57 
 
 		 682 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  32.54 
 
 		 692 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  35.17 
 
 		 667 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  35.05 
 
 		 692 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  35.83 
 
 		 693 aa  405  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  35.46 
 
 		 683 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  33.56 
 
 		 696 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  33.38 
 
 		 696 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  33.75 
 
 		 701 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  33.89 
 
 		 683 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  33.06 
 
 		 697 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  34.21 
 
 		 694 aa  399  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  34.72 
 
 		 697 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  35.28 
 
 		 683 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  34.31 
 
 		 697 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  34.79 
 
 		 694 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  35.8 
 
 		 701 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  33.47 
 
 		 701 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  35.41 
 
 		 686 aa  392  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  33.8 
 
 		 692 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  33.47 
 
 		 685 aa  392  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  33.85 
 
 		 691 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  33.19 
 
 		 683 aa  390  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  34.68 
 
 		 686 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  33.47 
 
 		 689 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  32.32 
 
 		 692 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  34.16 
 
 		 697 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  35.15 
 
 		 681 aa  387  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  35.86 
 
 		 688 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  32.32 
 
 		 697 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  34.8 
 
 		 686 aa  388  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  35.84 
 
 		 701 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  31.52 
 
 		 685 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  33.33 
 
 		 697 aa  386  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  32.27 
 
 		 693 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  35.46 
 
 		 687 aa  385  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  33.38 
 
 		 692 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  33.15 
 
 		 694 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  33.8 
 
 		 692 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  34.3 
 
 		 692 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  33.15 
 
 		 704 aa  382  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  33.89 
 
 		 692 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  33.1 
 
 		 692 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  33.29 
 
 		 695 aa  381  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2618  elongation factor G-like  37 
 
 		 693 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  35.94 
 
 		 691 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  34.26 
 
 		 690 aa  381  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  32.92 
 
 		 693 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  32.27 
 
 		 692 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  34.44 
 
 		 689 aa  382  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  32.32 
 
 		 688 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  33.84 
 
 		 692 aa  378  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  32.96 
 
 		 692 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  32.96 
 
 		 692 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  32.96 
 
 		 692 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  30.56 
 
 		 693 aa  376  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2704  small GTP-binding protein  36.57 
 
 		 693 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  32.96 
 
 		 692 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  33.43 
 
 		 691 aa  379  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  37.05 
 
 		 697 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  32.59 
 
 		 698 aa  377  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  33.47 
 
 		 701 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  31.9 
 
 		 692 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>