More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0135 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  100 
 
 		 699 aa  1445    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  43.62 
 
 		 707 aa  592  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  40.84 
 
 		 691 aa  551  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  39.22 
 
 		 691 aa  543  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  40.32 
 
 		 690 aa  543  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  40.32 
 
 		 696 aa  543  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  39.22 
 
 		 693 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  40.17 
 
 		 695 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  39.45 
 
 		 691 aa  538  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  38.24 
 
 		 692 aa  535  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  39.16 
 
 		 690 aa  536  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  39.36 
 
 		 691 aa  538  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  39.74 
 
 		 680 aa  532  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  39.5 
 
 		 679 aa  530  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7102  elongation factor G  39.72 
 
 		 710 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  40.43 
 
 		 694 aa  527  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  39.22 
 
 		 701 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  39.91 
 
 		 701 aa  520  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  37.59 
 
 		 695 aa  520  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  38.72 
 
 		 691 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  37.46 
 
 		 670 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_002950  PG0933  elongation factor G  38.52 
 
 		 719 aa  511  1e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.246025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  39.12 
 
 		 701 aa  510  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  39.36 
 
 		 683 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  38.9 
 
 		 701 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  37.28 
 
 		 694 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  39.4 
 
 		 703 aa  504  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  38.01 
 
 		 667 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  36.96 
 
 		 696 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  38.37 
 
 		 683 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  37.21 
 
 		 697 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  38.24 
 
 		 701 aa  499  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  37.45 
 
 		 673 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  36.59 
 
 		 696 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  38.05 
 
 		 688 aa  502  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  38.66 
 
 		 686 aa  498  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  39.21 
 
 		 682 aa  491  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  37.19 
 
 		 694 aa  491  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  36.6 
 
 		 682 aa  492  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  36.13 
 
 		 694 aa  491  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  38.23 
 
 		 703 aa  487  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  35.74 
 
 		 697 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  38.45 
 
 		 692 aa  485  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  36.65 
 
 		 697 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  35.74 
 
 		 697 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  35.74 
 
 		 697 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  37.59 
 
 		 673 aa  484  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  36.66 
 
 		 696 aa  479  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  36.63 
 
 		 689 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  37.5 
 
 		 686 aa  476  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  35.74 
 
 		 697 aa  476  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  36.46 
 
 		 692 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  36.57 
 
 		 697 aa  472  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  34.88 
 
 		 693 aa  474  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  36.36 
 
 		 692 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  36.36 
 
 		 692 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  36.51 
 
 		 692 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  36.39 
 
 		 691 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  36.36 
 
 		 692 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  36.09 
 
 		 692 aa  475  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  36.22 
 
 		 692 aa  472  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  36.36 
 
 		 692 aa  472  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  36.36 
 
 		 692 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  36.51 
 
 		 692 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  36.42 
 
 		 692 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  36.67 
 
 		 690 aa  469  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  36.22 
 
 		 692 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  34.65 
 
 		 691 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0153  elongation factor G  35.45 
 
 		 689 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  36.24 
 
 		 691 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2437  elongation factor G  36.24 
 
 		 691 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.318497 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  36.08 
 
 		 692 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  38.23 
 
 		 691 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  36.17 
 
 		 692 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1361  elongation factor G  35.29 
 
 		 690 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  35.81 
 
 		 691 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  35.29 
 
 		 697 aa  469  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  35.95 
 
 		 692 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2215  elongation factor G  36.38 
 
 		 691 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  34.64 
 
 		 693 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  34.73 
 
 		 698 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  35.68 
 
 		 692 aa  465  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  35.83 
 
 		 692 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  35.95 
 
 		 699 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  34.5 
 
 		 692 aa  463  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  34.4 
 
 		 698 aa  463  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  35.58 
 
 		 691 aa  463  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  37.16 
 
 		 690 aa  464  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  37.77 
 
 		 688 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5073  elongation factor G  35.72 
 
 		 690 aa  465  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193124  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.21 
 
 		 682 aa  462  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  36.47 
 
 		 691 aa  463  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  34.59 
 
 		 698 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  34.59 
 
 		 698 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  35.95 
 
 		 699 aa  463  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  34.69 
 
 		 698 aa  465  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  34.98 
 
 		 693 aa  462  1e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  35.34 
 
 		 692 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  34.59 
 
 		 698 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3187  elongation factor G  35.54 
 
 		 690 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>