More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5155 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3802  elongation factor G  54.75 
 
 		 729 aa  681    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.812471  normal  0.705979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  58.08 
 
 		 717 aa  716    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  57.47 
 
 		 717 aa  706    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2404  small GTP-binding protein  55.41 
 
 		 718 aa  734    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136608  normal  0.0116105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  59.17 
 
 		 719 aa  760    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2732  small GTP-binding protein  57.99 
 
 		 696 aa  655    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556066  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1361  elongation factor G  67.87 
 
 		 722 aa  881    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  57.6 
 
 		 714 aa  720    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0872  elongation factor G  56.67 
 
 		 722 aa  667    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5136  elongation factor G  58.16 
 
 		 713 aa  711    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6127  elongation factor G  60.28 
 
 		 710 aa  763    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220969  normal  0.933466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5155  elongation factor G  100 
 
 		 674 aa  1317    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212266  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  59.24 
 
 		 708 aa  779    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2028  elongation factor G  57.36 
 
 		 726 aa  679    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521312  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2340  elongation factor G  59.57 
 
 		 729 aa  754    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.468158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  60.92 
 
 		 719 aa  767    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  56.84 
 
 		 701 aa  709    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5225  elongation factor G  58.16 
 
 		 713 aa  711    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.526168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5517  elongation factor G  58.16 
 
 		 713 aa  711    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.469673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0290  small GTP-binding protein  50.78 
 
 		 770 aa  591  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2107  elongation factor G  57.92 
 
 		 741 aa  537  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000230841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  36.47 
 
 		 695 aa  435  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  35.31 
 
 		 696 aa  411  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  35.71 
 
 		 673 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  37.78 
 
 		 690 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  37.75 
 
 		 696 aa  405  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  36.74 
 
 		 680 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  35.55 
 
 		 682 aa  405  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  33.33 
 
 		 692 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  34.15 
 
 		 694 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  37.01 
 
 		 692 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  35.9 
 
 		 691 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  34.66 
 
 		 696 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  33.03 
 
 		 695 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  35.67 
 
 		 693 aa  389  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  34.46 
 
 		 670 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  34.1 
 
 		 696 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  37.21 
 
 		 677 aa  388  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  33.43 
 
 		 694 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  33.48 
 
 		 697 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  34.56 
 
 		 679 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  33.13 
 
 		 697 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  35.81 
 
 		 692 aa  385  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  34.68 
 
 		 667 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.92 
 
 		 682 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  34.7 
 
 		 694 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  35.22 
 
 		 673 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  33.43 
 
 		 697 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  32.78 
 
 		 701 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  34.41 
 
 		 691 aa  379  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  34.77 
 
 		 692 aa  373  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  35.25 
 
 		 698 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  34.1 
 
 		 701 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  36.45 
 
 		 686 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2618  elongation factor G-like  36.73 
 
 		 693 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  36.06 
 
 		 695 aa  375  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  35.09 
 
 		 701 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  35.01 
 
 		 697 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  35.75 
 
 		 681 aa  372  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2704  small GTP-binding protein  36.73 
 
 		 693 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  36.45 
 
 		 701 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  33.58 
 
 		 693 aa  372  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  35.55 
 
 		 692 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  35.95 
 
 		 701 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  32.84 
 
 		 701 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2799  small GTP-binding protein  36.43 
 
 		 693 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  34.88 
 
 		 701 aa  372  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  33.69 
 
 		 691 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  34.37 
 
 		 691 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2585  elongation factor G domain-containing protein  37.16 
 
 		 694 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.259754 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  32.93 
 
 		 692 aa  368  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  32.92 
 
 		 685 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  37.2 
 
 		 703 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  34.63 
 
 		 707 aa  365  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  33.98 
 
 		 692 aa  365  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  32.67 
 
 		 683 aa  365  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  32.67 
 
 		 683 aa  364  2e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  32.79 
 
 		 689 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  33.03 
 
 		 697 aa  364  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  33.53 
 
 		 692 aa  363  7.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  33.53 
 
 		 692 aa  362  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  36.73 
 
 		 688 aa  362  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0584  elongation factor G  33.49 
 
 		 693 aa  362  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768044  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0570  elongation factor G  33.49 
 
 		 693 aa  362  1e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  33.33 
 
 		 692 aa  362  1e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  33.44 
 
 		 688 aa  362  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  33.79 
 
 		 691 aa  362  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  33.53 
 
 		 692 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  33.53 
 
 		 692 aa  362  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  34.15 
 
 		 702 aa  362  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  32.62 
 
 		 685 aa  361  3e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  33.53 
 
 		 692 aa  360  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  33.28 
 
 		 704 aa  360  5e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  32.62 
 
 		 699 aa  360  5e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0320  translation elongation factor G  34.33 
 
 		 699 aa  360  5e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000439347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  33.38 
 
 		 692 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  33.38 
 
 		 692 aa  360  6e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  33.38 
 
 		 692 aa  360  6e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  33.38 
 
 		 692 aa  360  6e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  35.31 
 
 		 687 aa  360  7e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>