More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2107 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2107  elongation factor G  100 
 
 
741 aa  1450    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000230841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0872  elongation factor G  59.2 
 
 
722 aa  788    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6127  elongation factor G  58.74 
 
 
710 aa  784    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220969  normal  0.933466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2732  small GTP-binding protein  56.15 
 
 
696 aa  679    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556066  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  65.36 
 
 
717 aa  929    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0290  small GTP-binding protein  52.37 
 
 
770 aa  658    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  58.67 
 
 
719 aa  805    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2404  small GTP-binding protein  59.84 
 
 
718 aa  874    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136608  normal  0.0116105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1361  elongation factor G  52.29 
 
 
722 aa  665    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  57.71 
 
 
714 aa  796    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  59.16 
 
 
708 aa  833    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5136  elongation factor G  57.26 
 
 
713 aa  779    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5517  elongation factor G  57.26 
 
 
713 aa  779    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.469673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3802  elongation factor G  52.89 
 
 
729 aa  694    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.812471  normal  0.705979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  66.44 
 
 
717 aa  929    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2028  elongation factor G  59.04 
 
 
726 aa  791    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521312  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  57.66 
 
 
719 aa  812    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  56.29 
 
 
701 aa  753    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5155  elongation factor G  54.93 
 
 
674 aa  654    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212266  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5225  elongation factor G  57.26 
 
 
713 aa  779    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.526168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2340  elongation factor G  56.41 
 
 
729 aa  760    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.468158  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  35.88 
 
 
695 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  36.1 
 
 
679 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  33.01 
 
 
692 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  38.17 
 
 
690 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  33.38 
 
 
682 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  33.19 
 
 
696 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  35.16 
 
 
696 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  34.55 
 
 
667 aa  412  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  35.39 
 
 
683 aa  403  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  36.02 
 
 
691 aa  405  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  32.44 
 
 
694 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  33.47 
 
 
673 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  36.15 
 
 
686 aa  397  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  39.5 
 
 
687 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  35.32 
 
 
683 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  37.45 
 
 
686 aa  398  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  31.81 
 
 
697 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  34.98 
 
 
680 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  33.85 
 
 
673 aa  395  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  33.71 
 
 
670 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  32.91 
 
 
701 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  37.31 
 
 
688 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  32.51 
 
 
697 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  33.8 
 
 
694 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  33.57 
 
 
683 aa  387  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3402  elongation factor G  35.84 
 
 
730 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0312369 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2225  elongation factor G  35.18 
 
 
680 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  34.58 
 
 
692 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  33.71 
 
 
693 aa  389  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  34.45 
 
 
687 aa  386  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  31.84 
 
 
701 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  32.87 
 
 
682 aa  386  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  32.77 
 
 
694 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  36.39 
 
 
697 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  34.69 
 
 
701 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  34.6 
 
 
692 aa  379  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  36.44 
 
 
685 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  36.82 
 
 
701 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  31.99 
 
 
696 aa  381  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  34.58 
 
 
686 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.96 
 
 
682 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  31.25 
 
 
696 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  30.89 
 
 
696 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3227  small GTP-binding protein  40.19 
 
 
683 aa  379  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.717315  normal  0.0158872 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  33.19 
 
 
694 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  36.53 
 
 
701 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  31.7 
 
 
690 aa  375  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3719  elongation factor G  36.95 
 
 
700 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  35.29 
 
 
691 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  31.84 
 
 
697 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3749  elongation factor G  34.9 
 
 
688 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.158222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  33.66 
 
 
692 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  32.72 
 
 
683 aa  371  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  33.52 
 
 
695 aa  372  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  34.97 
 
 
699 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  33.19 
 
 
692 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  32.07 
 
 
692 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  31.67 
 
 
691 aa  368  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  32.87 
 
 
692 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  35.95 
 
 
707 aa  369  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  31.77 
 
 
692 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  31.01 
 
 
691 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  32.65 
 
 
698 aa  368  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  34.35 
 
 
707 aa  369  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  31.41 
 
 
692 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  34.12 
 
 
703 aa  364  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1382  elongation factor G  34.54 
 
 
684 aa  364  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  32.09 
 
 
688 aa  363  4e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  33.66 
 
 
692 aa  363  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  33.19 
 
 
689 aa  362  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  31.16 
 
 
692 aa  362  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  32.55 
 
 
691 aa  361  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  36.34 
 
 
688 aa  362  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  32.39 
 
 
685 aa  360  5e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  33 
 
 
685 aa  360  5e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2618  elongation factor G-like  35.86 
 
 
693 aa  360  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  32.35 
 
 
689 aa  359  8e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  33.24 
 
 
681 aa  359  9.999999999999999e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  33.1 
 
 
692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>