More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01510 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0059  small GTP-binding protein  54.26 
 
 		 691 aa  728    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  100 
 
 		 687 aa  1415    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  72.43 
 
 		 681 aa  1031    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  75.4 
 
 		 693 aa  1098    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  41.59 
 
 		 695 aa  548  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  41.55 
 
 		 670 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  41.17 
 
 		 692 aa  543  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  41.88 
 
 		 667 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  40.49 
 
 		 696 aa  544  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  42.06 
 
 		 690 aa  539  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  41.91 
 
 		 680 aa  539  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  41.34 
 
 		 696 aa  536  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  40.83 
 
 		 683 aa  529  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  40.3 
 
 		 679 aa  531  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  39.5 
 
 		 691 aa  528  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  41.88 
 
 		 673 aa  526  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  38.87 
 
 		 673 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  40.49 
 
 		 697 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  40.37 
 
 		 701 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  39.18 
 
 		 682 aa  521  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  40.4 
 
 		 697 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  40.65 
 
 		 682 aa  518  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  39.94 
 
 		 701 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  37.68 
 
 		 695 aa  512  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  41.41 
 
 		 686 aa  515  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  38.33 
 
 		 696 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  38.65 
 
 		 694 aa  510  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  40.47 
 
 		 686 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  39.33 
 
 		 697 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  38.03 
 
 		 696 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  40.91 
 
 		 688 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  39.85 
 
 		 683 aa  507  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  39.03 
 
 		 691 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  38.95 
 
 		 692 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  39.7 
 
 		 686 aa  505  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  39.62 
 
 		 692 aa  502  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  39.35 
 
 		 693 aa  504  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  38.73 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  39.09 
 
 		 692 aa  500  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  38.86 
 
 		 691 aa  501  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  38.12 
 
 		 692 aa  499  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  37.03 
 
 		 694 aa  502  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  40.11 
 
 		 701 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  38.47 
 
 		 691 aa  499  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  38.91 
 
 		 691 aa  497  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  39.71 
 
 		 703 aa  498  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  38.73 
 
 		 692 aa  498  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  38.39 
 
 		 697 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  38.59 
 
 		 683 aa  496  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  38.91 
 
 		 691 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  38.79 
 
 		 691 aa  496  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  37.99 
 
 		 694 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  39.32 
 
 		 692 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  38.59 
 
 		 692 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  38.47 
 
 		 692 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  38.62 
 
 		 691 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  38.6 
 
 		 692 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  37.43 
 
 		 697 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  39.63 
 
 		 696 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  38.09 
 
 		 689 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  37.22 
 
 		 697 aa  489  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  38.09 
 
 		 683 aa  491  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  38.73 
 
 		 692 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  39.88 
 
 		 694 aa  491  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  38.6 
 
 		 688 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  37.43 
 
 		 692 aa  490  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  37.19 
 
 		 692 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  38.18 
 
 		 698 aa  490  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  37.72 
 
 		 692 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  38.78 
 
 		 692 aa  487  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  37.13 
 
 		 692 aa  487  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  37.43 
 
 		 692 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  37.43 
 
 		 692 aa  488  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  37.57 
 
 		 692 aa  488  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  38.26 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  37.94 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  37.43 
 
 		 692 aa  486  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  37.43 
 
 		 692 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  37.43 
 
 		 692 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  38.05 
 
 		 692 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  38.68 
 
 		 692 aa  488  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  37.74 
 
 		 699 aa  486  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  38.98 
 
 		 685 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  38.9 
 
 		 701 aa  488  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  37.57 
 
 		 692 aa  489  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  38.94 
 
 		 704 aa  487  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  37.59 
 
 		 692 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  37.74 
 
 		 691 aa  488  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  37.43 
 
 		 692 aa  487  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  37.11 
 
 		 693 aa  483  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  37.21 
 
 		 694 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  38.05 
 
 		 697 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  38.2 
 
 		 697 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  38.2 
 
 		 697 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  37.74 
 
 		 699 aa  485  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  38.17 
 
 		 699 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  37.21 
 
 		 697 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  37.21 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  37.99 
 
 		 700 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  36.01 
 
 		 697 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>