More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2225 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1266  elongation factor G  50.22 
 
 		 684 aa  683    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.782059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0222  elongation factor G  48.82 
 
 		 683 aa  687    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3200  elongation factor G  48.08 
 
 		 682 aa  657    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3749  elongation factor G  53.37 
 
 		 688 aa  758    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.158222  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6425  elongation factor G  53.03 
 
 		 681 aa  752    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2225  elongation factor G  100 
 
 		 680 aa  1392    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2663  elongation factor G  48.52 
 
 		 682 aa  666    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3719  elongation factor G  52.54 
 
 		 700 aa  700    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1382  elongation factor G  50.15 
 
 		 684 aa  687    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3402  elongation factor G  52.25 
 
 		 730 aa  701    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312369 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5542  elongation factor G  54.06 
 
 		 686 aa  705    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000680  translation elongation factor G-related protein  49.93 
 
 		 674 aa  657    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1118  elongation factor G  47.56 
 
 		 682 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4182  elongation factor G  53.91 
 
 		 686 aa  698    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  38.28 
 
 		 695 aa  501  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  37.28 
 
 		 696 aa  465  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  36.52 
 
 		 688 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  34.49 
 
 		 691 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  38.6 
 
 		 708 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  36.89 
 
 		 680 aa  449  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  36.23 
 
 		 690 aa  436  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  36.81 
 
 		 690 aa  438  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  34.71 
 
 		 679 aa  435  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  37.17 
 
 		 703 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  34.32 
 
 		 694 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  34.86 
 
 		 695 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  34.65 
 
 		 693 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  36.53 
 
 		 719 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  34.66 
 
 		 691 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  35.35 
 
 		 691 aa  427  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  35.35 
 
 		 691 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  37.08 
 
 		 683 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  34.74 
 
 		 691 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  34.5 
 
 		 685 aa  425  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  33.43 
 
 		 692 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  36.36 
 
 		 656 aa  425  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  38.01 
 
 		 714 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  38.28 
 
 		 719 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  32.89 
 
 		 683 aa  419  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  33.73 
 
 		 696 aa  422  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  33.14 
 
 		 696 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  33.04 
 
 		 696 aa  422  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  35.24 
 
 		 691 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  36.34 
 
 		 683 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  36.63 
 
 		 686 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  35.01 
 
 		 682 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  35.59 
 
 		 707 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  34.73 
 
 		 687 aa  417  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  34.95 
 
 		 697 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  33.86 
 
 		 673 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  35.77 
 
 		 701 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.72 
 
 		 682 aa  415  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  33.78 
 
 		 682 aa  414  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  34.62 
 
 		 692 aa  414  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  34.5 
 
 		 685 aa  414  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  36.57 
 
 		 701 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  34.42 
 
 		 691 aa  412  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  33.57 
 
 		 697 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  36.88 
 
 		 701 aa  412  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  33.38 
 
 		 683 aa  411  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  34.74 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  31.75 
 
 		 695 aa  408  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  33.48 
 
 		 692 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  32.9 
 
 		 692 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  34.91 
 
 		 692 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  33.68 
 
 		 693 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  34.63 
 
 		 692 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  33.43 
 
 		 667 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  32 
 
 		 697 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  33.33 
 
 		 692 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  35.56 
 
 		 691 aa  405  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  34.49 
 
 		 692 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  34.49 
 
 		 692 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  34.49 
 
 		 692 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  34.49 
 
 		 692 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  34.49 
 
 		 692 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  34.49 
 
 		 692 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  34.49 
 
 		 692 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  33.78 
 
 		 689 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  34.51 
 
 		 699 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  33.29 
 
 		 703 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  33.62 
 
 		 673 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  33 
 
 		 690 aa  405  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  34.76 
 
 		 691 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  34.66 
 
 		 700 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  33.72 
 
 		 698 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  33 
 
 		 695 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  34.67 
 
 		 686 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  33.86 
 
 		 691 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  33.67 
 
 		 692 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  34.34 
 
 		 692 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  33.19 
 
 		 694 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  33 
 
 		 695 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  33.91 
 
 		 691 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  32.86 
 
 		 698 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  34.65 
 
 		 697 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  33.87 
 
 		 689 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  32.65 
 
 		 694 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  33.52 
 
 		 691 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  37.2 
 
 		 701 aa  402  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>