More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3719 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3719  elongation factor G  100 
 
 		 700 aa  1401    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252538 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0222  elongation factor G  57.23 
 
 		 683 aa  785    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3749  elongation factor G  60.94 
 
 		 688 aa  826    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.158222  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2225  elongation factor G  52.54 
 
 		 680 aa  715    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6425  elongation factor G  59.11 
 
 		 681 aa  810    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5542  elongation factor G  69.97 
 
 		 686 aa  923    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1382  elongation factor G  54.68 
 
 		 684 aa  730    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1266  elongation factor G  53.98 
 
 		 684 aa  721    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.782059  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4182  elongation factor G  68.93 
 
 		 686 aa  898    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3402  elongation factor G  67.73 
 
 		 730 aa  918    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312369 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3200  elongation factor G  48.29 
 
 		 682 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000680  translation elongation factor G-related protein  47.16 
 
 		 674 aa  657    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1118  elongation factor G  49.56 
 
 		 682 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2663  elongation factor G  49.4 
 
 		 682 aa  663    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  37.27 
 
 		 695 aa  479  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  36.46 
 
 		 688 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  35.24 
 
 		 692 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  36.39 
 
 		 691 aa  445  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  35.53 
 
 		 696 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  37.68 
 
 		 690 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  34.71 
 
 		 679 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  35.09 
 
 		 682 aa  423  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  36.18 
 
 		 680 aa  425  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  35.81 
 
 		 719 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  36.85 
 
 		 683 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  34.56 
 
 		 685 aa  421  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  35.16 
 
 		 687 aa  420  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  37.28 
 
 		 686 aa  418  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  33.97 
 
 		 696 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  33.77 
 
 		 695 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  37.57 
 
 		 683 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  35.39 
 
 		 708 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  35.15 
 
 		 692 aa  415  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  36.55 
 
 		 701 aa  413  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  36.97 
 
 		 714 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  36.06 
 
 		 699 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  36.15 
 
 		 688 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  36.42 
 
 		 701 aa  411  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  34.47 
 
 		 696 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  32.65 
 
 		 694 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  38.15 
 
 		 717 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  33.28 
 
 		 683 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  36.13 
 
 		 692 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  35.93 
 
 		 703 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  37.99 
 
 		 701 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  38.15 
 
 		 717 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5136  elongation factor G  37.08 
 
 		 713 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5517  elongation factor G  37.08 
 
 		 713 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.469673 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5225  elongation factor G  37.08 
 
 		 713 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.526168 
 
 
-
 
NC_002950  PG0933  elongation factor G  32.18 
 
 		 719 aa  400  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.246025 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  33.43 
 
 		 683 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  33.48 
 
 		 670 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  33.73 
 
 		 685 aa  400  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  34.4 
 
 		 693 aa  402  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  34.2 
 
 		 690 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  35.24 
 
 		 673 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  35.84 
 
 		 701 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  33.73 
 
 		 682 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  33.87 
 
 		 692 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  34.21 
 
 		 691 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  34.02 
 
 		 697 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  33.33 
 
 		 673 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  33.38 
 
 		 692 aa  399  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  32.23 
 
 		 697 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  34.68 
 
 		 704 aa  399  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  32.99 
 
 		 697 aa  399  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  32.9 
 
 		 691 aa  398  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  32.6 
 
 		 696 aa  399  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  33 
 
 		 692 aa  396  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6127  elongation factor G  36.77 
 
 		 710 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220969  normal  0.933466 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  33.53 
 
 		 698 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  33.04 
 
 		 692 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  32.81 
 
 		 698 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  34.38 
 
 		 687 aa  395  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  33.09 
 
 		 691 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  33.67 
 
 		 694 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  33.62 
 
 		 701 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  32.11 
 
 		 696 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0879  small GTP-binding protein  31.97 
 
 		 690 aa  393  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.323736  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  32.76 
 
 		 691 aa  391  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  33.05 
 
 		 691 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  35.43 
 
 		 719 aa  392  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  33.92 
 
 		 689 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  33.1 
 
 		 698 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  32.76 
 
 		 692 aa  392  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  34.41 
 
 		 686 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  33.1 
 
 		 698 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  33.1 
 
 		 698 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  33.43 
 
 		 697 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  37.37 
 
 		 677 aa  392  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  32.91 
 
 		 698 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000344622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  32.67 
 
 		 698 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  32.67 
 
 		 698 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  33.1 
 
 		 698 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  32.95 
 
 		 698 aa  392  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0237  elongation factor G  32.86 
 
 		 705 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000318631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  33.28 
 
 		 700 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  31.81 
 
 		 699 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  32.57 
 
 		 698 aa  389  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  31.81 
 
 		 699 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>