More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3402 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6425  elongation factor G  59.56 
 
 		 681 aa  839    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0222  elongation factor G  56.55 
 
 		 683 aa  770    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3749  elongation factor G  61.66 
 
 		 688 aa  858    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.158222  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2225  elongation factor G  52.25 
 
 		 680 aa  716    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2663  elongation factor G  46.27 
 
 		 682 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1266  elongation factor G  54.04 
 
 		 684 aa  729    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.782059  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5542  elongation factor G  67.65 
 
 		 686 aa  912    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000680  translation elongation factor G-related protein  46.53 
 
 		 674 aa  645    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1382  elongation factor G  56.55 
 
 		 684 aa  766    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3200  elongation factor G  46.48 
 
 		 682 aa  636    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3402  elongation factor G  100 
 
 		 730 aa  1469    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312369 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3719  elongation factor G  67.73 
 
 		 700 aa  922    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252538 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4182  elongation factor G  66.47 
 
 		 686 aa  896    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1118  elongation factor G  47.23 
 
 		 682 aa  632  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  36.11 
 
 		 695 aa  472  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  35.9 
 
 		 691 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  34.61 
 
 		 688 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  37.72 
 
 		 690 aa  450  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  36.7 
 
 		 696 aa  443  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  34.29 
 
 		 692 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  35.21 
 
 		 696 aa  431  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  34.93 
 
 		 687 aa  429  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  34.26 
 
 		 679 aa  428  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  36.22 
 
 		 680 aa  428  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  34.89 
 
 		 691 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  34.9 
 
 		 682 aa  421  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  35.42 
 
 		 690 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  33.48 
 
 		 683 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  35.11 
 
 		 673 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  36.79 
 
 		 708 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  35.95 
 
 		 707 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  36.22 
 
 		 701 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  33.24 
 
 		 685 aa  412  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  36.87 
 
 		 717 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  36.27 
 
 		 703 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  36.42 
 
 		 701 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  34.22 
 
 		 696 aa  414  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  31.86 
 
 		 696 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  36.15 
 
 		 719 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  36.86 
 
 		 656 aa  416  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  31.56 
 
 		 696 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  33.68 
 
 		 682 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  32.74 
 
 		 695 aa  411  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  35.7 
 
 		 699 aa  412  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  36.28 
 
 		 683 aa  411  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  35.47 
 
 		 683 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  36.03 
 
 		 686 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  33.58 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  35.38 
 
 		 688 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  33.53 
 
 		 683 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  35.65 
 
 		 691 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  34.63 
 
 		 719 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  34.44 
 
 		 687 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  33.19 
 
 		 691 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  33.38 
 
 		 685 aa  400  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  32.12 
 
 		 693 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  34.51 
 
 		 686 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2404  small GTP-binding protein  35.59 
 
 		 718 aa  402  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136608  normal  0.0116105 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  33.77 
 
 		 701 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  36.32 
 
 		 717 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  34.05 
 
 		 693 aa  401  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  33.67 
 
 		 673 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  36.8 
 
 		 701 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0933  elongation factor G  31.75 
 
 		 719 aa  398  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.246025 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  33.18 
 
 		 670 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  33.68 
 
 		 694 aa  399  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  33.67 
 
 		 692 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  31.28 
 
 		 694 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  32.07 
 
 		 690 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  32.8 
 
 		 697 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  34.03 
 
 		 692 aa  392  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  33 
 
 		 686 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0879  small GTP-binding protein  31.97 
 
 		 690 aa  390  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.323736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  37.96 
 
 		 687 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.13 
 
 		 682 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  34.85 
 
 		 685 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  32.5 
 
 		 692 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  32.66 
 
 		 697 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6127  elongation factor G  35.98 
 
 		 710 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220969  normal  0.933466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3227  small GTP-binding protein  39.88 
 
 		 683 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.717315  normal  0.0158872 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  33.71 
 
 		 704 aa  389  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  32.7 
 
 		 691 aa  389  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  36.15 
 
 		 714 aa  388  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  35.01 
 
 		 681 aa  387  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  34.74 
 
 		 688 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  33.67 
 
 		 695 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  35.95 
 
 		 677 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0059  small GTP-binding protein  34.73 
 
 		 691 aa  384  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  33.67 
 
 		 695 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  32.22 
 
 		 694 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0872  elongation factor G  36.31 
 
 		 722 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  31.99 
 
 		 697 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  32.62 
 
 		 704 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  31.07 
 
 		 694 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  32.31 
 
 		 697 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  32.62 
 
 		 703 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  32.37 
 
 		 692 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2340  elongation factor G  35.5 
 
 		 729 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.468158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  31.82 
 
 		 692 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  31.17 
 
 		 701 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>