More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1759 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1759  small GTP-binding protein  100 
 
 		 361 aa  717    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000555556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  48.55 
 
 		 420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  48.27 
 
 		 406 aa  300  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  50.72 
 
 		 421 aa  299  4e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  46.93 
 
 		 413 aa  269  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  42.52 
 
 		 437 aa  267  2e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  38.87 
 
 		 553 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  41.94 
 
 		 442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  39.29 
 
 		 435 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  38.83 
 
 		 487 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  38.99 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  40.9 
 
 		 435 aa  246  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  37.94 
 
 		 441 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  39.52 
 
 		 433 aa  243  3e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  37.46 
 
 		 431 aa  243  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  45.89 
 
 		 596 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  36.71 
 
 		 461 aa  242  7e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  40.4 
 
 		 582 aa  242  9e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  37.19 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  43.07 
 
 		 395 aa  239  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  35.56 
 
 		 479 aa  239  5e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  35.69 
 
 		 493 aa  239  5.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  37.99 
 
 		 414 aa  239  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  38.94 
 
 		 436 aa  239  6.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  37.4 
 
 		 454 aa  238  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  36.61 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  34.36 
 
 		 509 aa  237  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  37.01 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  37.43 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  37.69 
 
 		 414 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  37.78 
 
 		 564 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  34.37 
 
 		 502 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  37.72 
 
 		 434 aa  236  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  37.78 
 
 		 564 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  40.61 
 
 		 422 aa  236  6e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  38.53 
 
 		 412 aa  236  7e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  37.94 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  40.57 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  37.61 
 
 		 404 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  37.61 
 
 		 404 aa  232  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  43.44 
 
 		 420 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  34.35 
 
 		 482 aa  232  9e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  42.82 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  39.94 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  36.58 
 
 		 429 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  38.6 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  40.13 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  37.31 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  37.61 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  39.34 
 
 		 574 aa  230  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  37.61 
 
 		 387 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  37.61 
 
 		 396 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  37.61 
 
 		 387 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  37.61 
 
 		 387 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  37.61 
 
 		 387 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  37.61 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  36.04 
 
 		 435 aa  229  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  37.11 
 
 		 528 aa  229  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.39 
 
 		 493 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  35.85 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  35.29 
 
 		 515 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  37.31 
 
 		 414 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  37.01 
 
 		 396 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  35.14 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  37.01 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  37.01 
 
 		 395 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  37.01 
 
 		 395 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  37.46 
 
 		 406 aa  226  4e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1232  GTP-binding proten HflX  38.12 
 
 		 415 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000402227  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  37.01 
 
 		 396 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.12 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.62 
 
 		 486 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  38.55 
 
 		 425 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  36.53 
 
 		 458 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  34.07 
 
 		 484 aa  225  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  35.65 
 
 		 517 aa  225  8e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  41.62 
 
 		 597 aa  225  8e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  41.62 
 
 		 597 aa  225  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  35.31 
 
 		 521 aa  224  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1231  GTP-binding proten HflX  40.51 
 
 		 370 aa  225  1e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  36.24 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  35.44 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  34.53 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  40.75 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  39.47 
 
 		 396 aa  223  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  38.11 
 
 		 535 aa  223  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  38.07 
 
 		 375 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  37.54 
 
 		 412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  34.53 
 
 		 429 aa  222  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  36.34 
 
 		 435 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  36.34 
 
 		 435 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  36.06 
 
 		 440 aa  222  9e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  36.14 
 
 		 445 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1623  GTP-binding proten HflX  41.57 
 
 		 408 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  36.42 
 
 		 481 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  38.33 
 
 		 432 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  36.34 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  37.01 
 
 		 435 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  34.89 
 
 		 485 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  33.98 
 
 		 512 aa  220  3e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>