More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0635 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0635  cell cycle protein  100 
 
 		 354 aa  688    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0123937  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0088  cell cycle protein  44.67 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000070241  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1005  cell cycle protein  47.35 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0721035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0088  cell cycle protein  43.36 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  37.21 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  36.63 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  36.77 
 
 		 376 aa  212  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  36.05 
 
 		 368 aa  210  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  37.82 
 
 		 365 aa  209  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  35.17 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  36.34 
 
 		 368 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  35.94 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  35.47 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  35.47 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  35.63 
 
 		 367 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  35.63 
 
 		 367 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  32.99 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  34.59 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  32.99 
 
 		 407 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  35.17 
 
 		 368 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  35.17 
 
 		 368 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  35.17 
 
 		 368 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  36.51 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  35.17 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  32.29 
 
 		 408 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  34.02 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2764  rod shape-determining protein RodA  37.8 
 
 		 359 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  36 
 
 		 369 aa  189  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  35.75 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  32.66 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  33.99 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  32.76 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  34.01 
 
 		 373 aa  185  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  33.68 
 
 		 408 aa  185  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  33.91 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  34.36 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  32.65 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  30.73 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  33.72 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  36.92 
 
 		 380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0930  rod shape-determining protein RodA  36.74 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  36.69 
 
 		 373 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  38.13 
 
 		 390 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  31.64 
 
 		 374 aa  182  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  34.01 
 
 		 364 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  34.41 
 
 		 403 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  31.66 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  32.08 
 
 		 360 aa  180  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  33.43 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  35.4 
 
 		 382 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1368  cell cycle protein  34.38 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  36 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  34.43 
 
 		 371 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  33.92 
 
 		 367 aa  179  8e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  30.56 
 
 		 422 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  35.59 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  32.94 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  31.95 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  29.56 
 
 		 422 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  32.25 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  38.76 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  35.01 
 
 		 379 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  32.74 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  32.76 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  36.79 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  33.33 
 
 		 379 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  34.3 
 
 		 371 aa  176  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000981  rod shape-determining protein RodA  32.37 
 
 		 360 aa  176  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  37.18 
 
 		 385 aa  176  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  34.14 
 
 		 368 aa  176  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  35.28 
 
 		 371 aa  175  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  32.24 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  33.33 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  32.55 
 
 		 366 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  32.85 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  34.06 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  32.28 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2391  cell cycle protein FtsW  35 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00202721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  34.06 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  29.7 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  32.97 
 
 		 378 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2103  cell cycle protein FtsW  34.88 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000319192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  30.45 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  29.27 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  35.29 
 
 		 366 aa  173  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  31.78 
 
 		 389 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  30.89 
 
 		 438 aa  172  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  32.45 
 
 		 366 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  31.48 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  32.91 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  34.95 
 
 		 373 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  30.59 
 
 		 373 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  30.59 
 
 		 373 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  33.12 
 
 		 381 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  34.1 
 
 		 376 aa  169  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  30.06 
 
 		 384 aa  169  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  36.56 
 
 		 370 aa  169  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  32.97 
 
 		 412 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  31.27 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  36.18 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>