More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1546 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1546  putative acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 510 aa  1016    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  51.59 
 
 		 539 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.861325  hitchhiker  0.000258347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 		 557 aa  369  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3235  AMP-dependent synthetase and ligase  39.66 
 
 		 530 aa  352  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0083  AMP-dependent synthetase and ligase  40.23 
 
 		 525 aa  349  8e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6131  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0231902 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  37.14 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20370  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  38.69 
 
 		 504 aa  285  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 554 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 548 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 		 547 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 549 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 561 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  35.34 
 
 		 556 aa  270  5.9999999999999995e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0862  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0216269  hitchhiker  0.00000155226 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0821  acetyl-CoA synthetase  32.31 
 
 		 569 aa  265  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0325242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 555 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 		 562 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0838  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 		 573 aa  261  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2545  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 563 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  34.05 
 
 		 555 aa  256  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 552 aa  256  9e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  34.05 
 
 		 555 aa  256  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 557 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 555 aa  251  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 557 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 		 555 aa  249  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 		 498 aa  248  1e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 555 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 552 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3109  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 557 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396684  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 555 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2909  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 		 563 aa  245  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522952  normal  0.436285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 555 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 		 560 aa  213  7.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1859  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 503 aa  206  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.536821  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  28.12 
 
 		 572 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  28.12 
 
 		 572 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  27.83 
 
 		 572 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  27.76 
 
 		 572 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  27.93 
 
 		 572 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  27.83 
 
 		 572 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  27.83 
 
 		 572 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  27.93 
 
 		 572 aa  203  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  28.12 
 
 		 572 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  27.93 
 
 		 572 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  27.93 
 
 		 572 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 539 aa  202  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 539 aa  202  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  27.94 
 
 		 568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  27.94 
 
 		 568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  30.27 
 
 		 551 aa  197  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  30.35 
 
 		 547 aa  194  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 		 571 aa  190  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 543 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 525 aa  187  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 		 576 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4225  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 		 508 aa  186  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217524  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 		 609 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 562 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 		 544 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 		 568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 543 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 568 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  27.31 
 
 		 531 aa  184  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 		 566 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  26.24 
 
 		 571 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  30.22 
 
 		 598 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  28.68 
 
 		 558 aa  183  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 555 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 538 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0429  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 572 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  25.37 
 
 		 571 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  28.82 
 
 		 535 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 548 aa  180  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 541 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 		 522 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 		 555 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 		 539 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 566 aa  177  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1854  AMP-dependent synthetase and ligase  28.36 
 
 		 567 aa  177  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  28.46 
 
 		 568 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  29.22 
 
 		 576 aa  176  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  27.89 
 
 		 588 aa  176  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 539 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 		 552 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 530 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 		 555 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 513 aa  176  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 		 593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 532 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 		 562 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 		 528 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  27.34 
 
 		 589 aa  173  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 		 576 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  30.46 
 
 		 541 aa  172  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  26.49 
 
 		 588 aa  172  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  27.73 
 
 		 594 aa  172  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 548 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>