More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3235 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3235  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 530 aa  1055    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  49.07 
 
 		 557 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6131  AMP-dependent synthetase and ligase  48.36 
 
 		 557 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0231902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0083  AMP-dependent synthetase and ligase  49.71 
 
 		 525 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  45.08 
 
 		 539 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.861325  hitchhiker  0.000258347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  43.87 
 
 		 562 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2909  AMP-dependent synthetase and ligase  43.08 
 
 		 563 aa  361  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522952  normal  0.436285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  41.62 
 
 		 561 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  41.98 
 
 		 549 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  41.87 
 
 		 548 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  42.8 
 
 		 556 aa  356  5.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  42.18 
 
 		 547 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1546  putative acyl-CoA synthetase  39.77 
 
 		 510 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  41.79 
 
 		 555 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  41.65 
 
 		 555 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  39.77 
 
 		 554 aa  350  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  41.9 
 
 		 555 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  42.72 
 
 		 555 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 		 557 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 		 557 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0862  AMP-dependent synthetase and ligase  38.24 
 
 		 554 aa  348  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0216269  hitchhiker  0.00000155226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  43.07 
 
 		 553 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2545  AMP-dependent synthetase and ligase  41.46 
 
 		 563 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  42.5 
 
 		 555 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  42.12 
 
 		 555 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0821  acetyl-CoA synthetase  38.14 
 
 		 569 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0325242 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0838  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 		 573 aa  340  4e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  41.75 
 
 		 555 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  41.56 
 
 		 555 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3109  AMP-dependent synthetase and ligase  41.44 
 
 		 557 aa  332  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396684  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20370  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  43.8 
 
 		 504 aa  325  1e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  37.76 
 
 		 552 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 		 552 aa  319  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 498 aa  301  3e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  33.46 
 
 		 568 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  33.46 
 
 		 568 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 560 aa  263  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  33.9 
 
 		 572 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  33.9 
 
 		 572 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  33.9 
 
 		 572 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  33.9 
 
 		 572 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  33.9 
 
 		 572 aa  261  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  33.9 
 
 		 572 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  33.9 
 
 		 572 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  33.84 
 
 		 572 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  33.84 
 
 		 572 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  33.9 
 
 		 572 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  35.91 
 
 		 607 aa  259  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 		 571 aa  257  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 		 537 aa  257  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  32.83 
 
 		 572 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  31.47 
 
 		 571 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  31.41 
 
 		 571 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 522 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  36.01 
 
 		 588 aa  247  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  33.71 
 
 		 587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  33.91 
 
 		 535 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 609 aa  244  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  34.21 
 
 		 585 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  32.47 
 
 		 588 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 555 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 584 aa  239  8e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 558 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 513 aa  239  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  34.52 
 
 		 592 aa  239  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 576 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  31.8 
 
 		 528 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 567 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  31.19 
 
 		 528 aa  237  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  31.19 
 
 		 528 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  33.89 
 
 		 598 aa  237  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  34.24 
 
 		 602 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  33.77 
 
 		 588 aa  236  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  31.19 
 
 		 528 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 530 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  33.77 
 
 		 588 aa  236  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  35 
 
 		 588 aa  236  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  31.19 
 
 		 528 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 		 539 aa  236  8e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 528 aa  236  8e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  31.19 
 
 		 522 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 		 539 aa  236  8e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  30.99 
 
 		 522 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  31.23 
 
 		 563 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 552 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 528 aa  234  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  31.33 
 
 		 528 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 		 559 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  33.99 
 
 		 525 aa  233  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 		 555 aa  233  6e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 598 aa  233  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 584 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 		 548 aa  232  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  30.58 
 
 		 528 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 616 aa  232  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  33.09 
 
 		 535 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  34.67 
 
 		 556 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 553 aa  229  6e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 530 aa  230  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 559 aa  229  7e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>