More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2702 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 498 aa  1016    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  40.45 
 
 		 552 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0083  AMP-dependent synthetase and ligase  42.76 
 
 		 525 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  39.43 
 
 		 552 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6131  AMP-dependent synthetase and ligase  41.51 
 
 		 557 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0231902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  37.07 
 
 		 557 aa  346  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  38.08 
 
 		 548 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2909  AMP-dependent synthetase and ligase  39.61 
 
 		 563 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522952  normal  0.436285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  38.24 
 
 		 554 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 		 547 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  38.35 
 
 		 555 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  38.35 
 
 		 555 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0821  acetyl-CoA synthetase  38.24 
 
 		 569 aa  342  9e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0325242 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0862  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 		 554 aa  341  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0216269  hitchhiker  0.00000155226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  39.87 
 
 		 561 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  37.08 
 
 		 556 aa  339  8e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  39.67 
 
 		 549 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 553 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0838  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 		 573 aa  335  1e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2545  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 		 563 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  38.84 
 
 		 557 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 		 562 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  38.64 
 
 		 557 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 555 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  37.81 
 
 		 555 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  37.81 
 
 		 555 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  37.81 
 
 		 555 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 		 555 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  36.75 
 
 		 568 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  36.75 
 
 		 568 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3109  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 557 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  36.46 
 
 		 571 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  35.73 
 
 		 571 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  36.26 
 
 		 572 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  36.26 
 
 		 572 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  36.26 
 
 		 572 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  35.75 
 
 		 572 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  36.26 
 
 		 572 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  36.26 
 
 		 572 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  36.26 
 
 		 572 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  36.26 
 
 		 572 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  36.26 
 
 		 572 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  36.07 
 
 		 572 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 		 555 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  36.07 
 
 		 572 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20370  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  39.42 
 
 		 504 aa  308  1.0000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  34.71 
 
 		 588 aa  303  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  34.71 
 
 		 588 aa  303  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3235  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 530 aa  297  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  33.09 
 
 		 587 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 537 aa  294  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  33.09 
 
 		 588 aa  293  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  33.76 
 
 		 584 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 562 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  32.11 
 
 		 592 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  32.91 
 
 		 584 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 602 aa  282  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  33.63 
 
 		 585 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  32.86 
 
 		 607 aa  282  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  34.78 
 
 		 598 aa  280  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  31.35 
 
 		 588 aa  279  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 539 aa  273  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.861325  hitchhiker  0.000258347 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 548 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 609 aa  270  5.9999999999999995e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 		 576 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 522 aa  267  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 		 571 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  31.53 
 
 		 576 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 552 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 560 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  37.68 
 
 		 566 aa  261  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 528 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 598 aa  260  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 555 aa  260  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 567 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 532 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  32.34 
 
 		 551 aa  257  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 555 aa  257  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 525 aa  257  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  32.65 
 
 		 555 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  34.07 
 
 		 588 aa  256  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  32.65 
 
 		 541 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 		 544 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  32.65 
 
 		 541 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 		 616 aa  256  6e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  32.65 
 
 		 541 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  32.65 
 
 		 541 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 		 538 aa  256  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 547 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  34.97 
 
 		 531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  32.47 
 
 		 541 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 541 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  32.73 
 
 		 535 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  32.47 
 
 		 555 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 556 aa  252  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0683421  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  32.47 
 
 		 541 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  34.22 
 
 		 528 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 566 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  34.22 
 
 		 528 aa  249  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  34.22 
 
 		 528 aa  249  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>