More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2198 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 539 aa  1069    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.861325  hitchhiker  0.000258347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1546  putative acyl-CoA synthetase  51.78 
 
 		 510 aa  483  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  47.1 
 
 		 557 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6131  AMP-dependent synthetase and ligase  45.69 
 
 		 557 aa  422  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0231902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3235  AMP-dependent synthetase and ligase  45.15 
 
 		 530 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0083  AMP-dependent synthetase and ligase  46.1 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20370  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  43.4 
 
 		 504 aa  334  2e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  41.59 
 
 		 556 aa  333  4e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  41.06 
 
 		 557 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  39 
 
 		 554 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 		 555 aa  319  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  40.87 
 
 		 557 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  41.07 
 
 		 553 aa  317  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2909  AMP-dependent synthetase and ligase  41.62 
 
 		 563 aa  315  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522952  normal  0.436285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  41.04 
 
 		 555 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  40.23 
 
 		 562 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  41.23 
 
 		 555 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  41.23 
 
 		 555 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  40.85 
 
 		 555 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  41.02 
 
 		 548 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  40.82 
 
 		 549 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  40.96 
 
 		 555 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  40.73 
 
 		 547 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  39.88 
 
 		 561 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 		 555 aa  309  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  40.43 
 
 		 555 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0862  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0216269  hitchhiker  0.00000155226 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0821  acetyl-CoA synthetase  36.85 
 
 		 569 aa  301  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0325242 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3109  AMP-dependent synthetase and ligase  38.79 
 
 		 557 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2545  AMP-dependent synthetase and ligase  39.26 
 
 		 563 aa  299  8e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0838  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 		 573 aa  297  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 		 552 aa  290  6e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 		 552 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 498 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 		 576 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  31.4 
 
 		 572 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  31.21 
 
 		 572 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  31.21 
 
 		 572 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  31.21 
 
 		 572 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  32.53 
 
 		 572 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  31.21 
 
 		 572 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  32.53 
 
 		 572 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  31.03 
 
 		 572 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  31.03 
 
 		 572 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1859  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 503 aa  233  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.536821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 		 562 aa  232  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  32.33 
 
 		 572 aa  229  9e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  33.96 
 
 		 513 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  34.83 
 
 		 555 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  35.21 
 
 		 541 aa  228  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  30.65 
 
 		 572 aa  228  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 539 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  34.64 
 
 		 541 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  34.64 
 
 		 541 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  34.64 
 
 		 555 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  34.64 
 
 		 541 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  34.78 
 
 		 541 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  34.64 
 
 		 541 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 539 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 560 aa  224  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 547 aa  224  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  34.76 
 
 		 585 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  33.66 
 
 		 598 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  28.45 
 
 		 568 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  28.45 
 
 		 568 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 		 539 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 532 aa  220  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 538 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 557 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 571 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  31.82 
 
 		 551 aa  217  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 		 530 aa  216  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 539 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 539 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  30.68 
 
 		 571 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 539 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  30.22 
 
 		 571 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 535 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  33.09 
 
 		 562 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  33 
 
 		 567 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 544 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 537 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 564 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 564 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 558 aa  213  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1187  AMP-dependent synthetase and ligase  32.92 
 
 		 562 aa  213  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  32.23 
 
 		 549 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  32.14 
 
 		 535 aa  213  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 553 aa  213  9e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 522 aa  210  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 546 aa  210  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5127  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 568 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.46532 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  29.41 
 
 		 552 aa  210  7e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  31.27 
 
 		 584 aa  209  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 548 aa  209  8e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 587 aa  209  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 		 555 aa  209  8e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  34.78 
 
 		 588 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 565 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>