More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1859 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1859  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 503 aa  1031    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.536821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  37.05 
 
 		 554 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 		 548 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 		 547 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 		 561 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 549 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 		 562 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 		 553 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  33.89 
 
 		 555 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  33.89 
 
 		 555 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2545  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 563 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  33.25 
 
 		 556 aa  240  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2909  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 		 563 aa  239  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522952  normal  0.436285 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0821  acetyl-CoA synthetase  30.66 
 
 		 569 aa  237  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0325242 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0862  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 554 aa  237  4e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0216269  hitchhiker  0.00000155226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0083  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 		 525 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0838  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 573 aa  234  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  33.17 
 
 		 555 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 		 555 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 539 aa  231  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.861325  hitchhiker  0.000258347 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 557 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 557 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 555 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 555 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 555 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 555 aa  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 		 557 aa  223  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3109  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 557 aa  221  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.396684  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20370  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  33.1 
 
 		 504 aa  218  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6131  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 		 557 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0231902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1546  putative acyl-CoA synthetase  32.33 
 
 		 510 aa  206  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 		 552 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  28.67 
 
 		 552 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3235  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 		 530 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 		 498 aa  164  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 595 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  27.56 
 
 		 576 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 		 539 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 		 539 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 541 aa  157  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  27.21 
 
 		 535 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 557 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  28 
 
 		 535 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 539 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  28.68 
 
 		 543 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 		 576 aa  149  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 		 543 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2671  AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 624 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  26.85 
 
 		 522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  28.57 
 
 		 607 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  28.47 
 
 		 539 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  28.47 
 
 		 539 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 		 630 aa  148  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1890  propionate--CoA ligase  27.87 
 
 		 695 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.964967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  27.77 
 
 		 623 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  28.64 
 
 		 598 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1575  AMP-dependent synthetase and ligase  25.4 
 
 		 627 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  27.19 
 
 		 539 aa  147  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1721  AMP-dependent synthetase and ligase  26.07 
 
 		 652 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  24.94 
 
 		 572 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  27.36 
 
 		 539 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32550  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  27.68 
 
 		 644 aa  146  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113888  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  24.94 
 
 		 572 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  27.38 
 
 		 551 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  24.94 
 
 		 572 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 		 562 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  24.94 
 
 		 572 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1176  AMP-dependent synthetase and ligase  25.32 
 
 		 631 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  24.94 
 
 		 572 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02248  Propionyl CoA synthase  26.15 
 
 		 636 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.267498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  24.88 
 
 		 572 aa  144  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0012  AMP-dependent synthetase and ligase  27.19 
 
 		 634 aa  143  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  24.71 
 
 		 572 aa  143  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 		 553 aa  143  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0245  AMP-dependent synthetase and ligase  28.06 
 
 		 630 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1592  acyl-CoA sythetase  28.06 
 
 		 638 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 		 553 aa  143  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  24.71 
 
 		 572 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2340  AMP-dependent synthetase and ligase  27.57 
 
 		 539 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  28.05 
 
 		 602 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  28.41 
 
 		 592 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  24.71 
 
 		 572 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  26.3 
 
 		 629 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  28.57 
 
 		 541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1574  AMP-dependent synthetase and ligase  28.48 
 
 		 630 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2319  AMP-dependent synthetase and ligase  25.45 
 
 		 635 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  27.21 
 
 		 535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1168  AMP-dependent synthetase and ligase  25.51 
 
 		 637 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.313288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  24.48 
 
 		 572 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  25.17 
 
 		 572 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0273  AMP-dependent synthetase and ligase  27.58 
 
 		 630 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  25.29 
 
 		 568 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  25.29 
 
 		 568 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 		 598 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2391  AMP-dependent synthetase and ligase  25.23 
 
 		 640 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.977158 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1511  propionate--CoA ligase  24.95 
 
 		 634 aa  140  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.919396  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  27.64 
 
 		 657 aa  140  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  27.91 
 
 		 556 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  27.35 
 
 		 588 aa  139  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  25.29 
 
 		 571 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>