57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1260 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1260  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 		 543 aa  1067    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0268385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7652  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.99 
 
 		 592 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3454  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  30.41 
 
 		 568 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4512  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.17 
 
 		 597 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9182  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.38 
 
 		 628 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8360  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.55 
 
 		 433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2716  alanine-rich protein  32.32 
 
 		 344 aa  112  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0148  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.8 
 
 		 585 aa  83.6  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8359  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.62 
 
 		 1005 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0574  DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit sigma24 -like protein  32.4 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.423328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0393  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.07 
 
 		 484 aa  67  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.041427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4964  hypothetical protein  44.32 
 
 		 197 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920058  normal  0.171463 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2870  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  30 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5095  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.42 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000320537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4577  sigma-70 region 2 domain-containing protein  27.53 
 
 		 244 aa  55.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.598832  normal  0.0440159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1288  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  21.14 
 
 		 183 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.40806 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0900  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.64 
 
 		 191 aa  50.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.581812  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6380  RNA polymerase sigma factor  27.9 
 
 		 241 aa  50.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02709  RNA polymerase sigma factor  28.16 
 
 		 185 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1596  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.9 
 
 		 235 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0297  RNA polymerase sigma factor  22.34 
 
 		 188 aa  48.9  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1551  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.94 
 
 		 532 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.357255  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0952  RNA polymerase factor sigma-70  26.88 
 
 		 331 aa  48.9  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4389  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.91 
 
 		 201 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2181  RNA polymerase factor sigma-70  26.4 
 
 		 333 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5730  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.89 
 
 		 327 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1358  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.56 
 
 		 193 aa  47  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0862  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.31 
 
 		 580 aa  47  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0731  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.74 
 
 		 201 aa  47  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2267  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.9 
 
 		 196 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0916495  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0132  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  22.8 
 
 		 187 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00499196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3642  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.78 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20157  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2725  RNA polymerase sigma-70 factor  25.44 
 
 		 192 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.964229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.11 
 
 		 185 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.88792 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3845  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.28 
 
 		 185 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00095099  decreased coverage  0.00000359528 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6256  RNA polymerase sigma factor  32.41 
 
 		 237 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4193  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.14 
 
 		 200 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0459  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.86 
 
 		 177 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4403  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.74 
 
 		 192 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0790596  normal  0.211953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1215  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  22.75 
 
 		 187 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1660  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  24 
 
 		 174 aa  45.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.379101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2124  RNA polymerase sigma factor  27.42 
 
 		 226 aa  45.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7084  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.4 
 
 		 203 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  21.76 
 
 		 420 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2791  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.35 
 
 		 201 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.080251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1327  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  24.49 
 
 		 202 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00289153  normal  0.01768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  20.11 
 
 		 206 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000775614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9040  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.57 
 
 		 219 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3185  RNA polymerase factor sigma-70  30.56 
 
 		 368 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0418907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7326  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.95 
 
 		 303 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310531  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0303  RNA polymerase sigma-70 factor  20.67 
 
 		 203 aa  43.9  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000168317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2829  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.09 
 
 		 206 aa  43.9  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1793  transcriptional regulator, LuxR family  24.37 
 
 		 203 aa  43.9  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5462  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.88 
 
 		 171 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000000465068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  36.78 
 
 		 775 aa  43.5  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3684  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  23.53 
 
 		 247 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.328373  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3991  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.49 
 
 		 186 aa  43.5  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75873  normal  0.554715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>