15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0393 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0393  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 		 484 aa  921    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.041427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0574  DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit sigma24 -like protein  38.79 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.423328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9182  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.69 
 
 		 628 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7652  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.08 
 
 		 592 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1260  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.07 
 
 		 543 aa  70.5  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0268385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8360  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.14 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0148  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.18 
 
 		 585 aa  63.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3454  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  28.14 
 
 		 568 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4512  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.57 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2716  alanine-rich protein  27.2 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3642  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.41 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20157  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  33.87 
 
 		 2449 aa  46.6  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4272  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.68 
 
 		 666 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0898  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.55 
 
 		 168 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2870  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  26.95 
 
 		 534 aa  43.1  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>