24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2870 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2870  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  100 
 
 		 534 aa  1025    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8182  hypothetical protein  45.99 
 
 		 662 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3642  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.63 
 
 		 430 aa  62  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8360  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.05 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9182  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.52 
 
 		 628 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1260  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.89 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0268385  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1551  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.82 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.357255  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8781  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.26 
 
 		 183 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7652  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.14 
 
 		 592 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44150  FecI-like iron uptake RNA polymerase sigma factor  30.07 
 
 		 168 aa  50.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155686  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5489  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.57 
 
 		 189 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4272  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.47 
 
 		 666 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0480  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.11 
 
 		 1321 aa  48.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0759  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.62 
 
 		 180 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.496896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  25.97 
 
 		 2914 aa  47  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4469  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.11 
 
 		 191 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00981278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1596  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30 
 
 		 235 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0194  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.14 
 
 		 206 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359806  normal  0.0266346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3454  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  44.78 
 
 		 568 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37990  RNA polymerase sigma factor  24.84 
 
 		 168 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000275942  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00950  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family/RNA polymerase sigma-70 factor, sigma-E family  27.81 
 
 		 197 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1383  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  29.87 
 
 		 169 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00102713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22650  RNA polymerase sigma factor, ECF subfamily  26.86 
 
 		 174 aa  45.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308383  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2681  sigma-24 (FecI-like)  26.11 
 
 		 179 aa  45.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>