20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0574 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0574  DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit sigma24 -like protein  100 
 
 		 477 aa  919    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.423328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0393  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.02 
 
 		 484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.041427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9182  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.52 
 
 		 628 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3454  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  28.67 
 
 		 568 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1260  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.84 
 
 		 543 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0268385  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2716  alanine-rich protein  34.07 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7652  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.42 
 
 		 592 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0148  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.39 
 
 		 585 aa  67.4  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8360  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.47 
 
 		 433 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4272  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.33 
 
 		 666 aa  63.9  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4512  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.68 
 
 		 597 aa  63.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  33.81 
 
 		 2449 aa  60.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8359  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.69 
 
 		 1005 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  28.45 
 
 		 3409 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1596  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30 
 
 		 235 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2881  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.54 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4437  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.58 
 
 		 170 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.302453 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  28.95 
 
 		 1888 aa  48.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2870  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  32.64 
 
 		 534 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7240  putative RNA polymerase sigma factor  27.78 
 
 		 524 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00570923  normal  0.19325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>