51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4512 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4512  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 		 597 aa  1131    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9182  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.75 
 
 		 628 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3454  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  32.1 
 
 		 568 aa  148  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8360  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.32 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7652  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.09 
 
 		 592 aa  127  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1260  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32 
 
 		 543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0268385  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2716  alanine-rich protein  30.32 
 
 		 344 aa  97.4  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8359  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.39 
 
 		 1005 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4964  hypothetical protein  47.92 
 
 		 197 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.920058  normal  0.171463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4272  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.74 
 
 		 666 aa  75.1  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0148  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.68 
 
 		 585 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0393  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.54 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.041427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.28 
 
 		 2449 aa  64.7  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  39.56 
 
 		 2272 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3642  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.53 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.20157  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  34.19 
 
 		 1888 aa  59.7  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0574  DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit sigma24 -like protein  32.93 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.423328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  40.51 
 
 		 2179 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0420  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.82 
 
 		 310 aa  57  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.512317  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0350  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.12 
 
 		 311 aa  55.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1551  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.76 
 
 		 532 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.357255  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0150  RNA polymerase sigma factor SigW  26.37 
 
 		 190 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4444  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.05 
 
 		 220 aa  53.9  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3810  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.05 
 
 		 188 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0544  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.82 
 
 		 214 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3845  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.41 
 
 		 185 aa  51.6  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00095099  decreased coverage  0.00000359528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6736  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.05 
 
 		 217 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1358  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.57 
 
 		 193 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  26.35 
 
 		 3472 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  33.33 
 
 		 3471 aa  50.4  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5095  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.84 
 
 		 246 aa  50.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000320537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2791  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.99 
 
 		 201 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.080251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6134  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.12 
 
 		 301 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 3521 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1625  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.86 
 
 		 191 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  29.37 
 
 		 1859 aa  49.7  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0988  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.87 
 
 		 185 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  31.91 
 
 		 3409 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2662  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.15 
 
 		 172 aa  48.5  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.81941e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0794  sigma-24 (FecI-like)  25.82 
 
 		 285 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0842  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.27 
 
 		 288 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0846  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.27 
 
 		 292 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1410  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.21 
 
 		 192 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3759  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.58 
 
 		 180 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000323311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  29.55 
 
 		 2397 aa  45.8  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7326  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  26.84 
 
 		 303 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310531  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2293  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.93 
 
 		 201 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2569  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  23.37 
 
 		 193 aa  44.3  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2634  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.81 
 
 		 177 aa  44.3  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.530594  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  47.06 
 
 		 2313 aa  43.9  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5221  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.28 
 
 		 529 aa  43.9  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>