More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0094 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0094  nifS protein, putative  100 
 
 		 384 aa  786    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  27.3 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  21.89 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  23.1 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  24.46 
 
 		 398 aa  79.3  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  21.82 
 
 		 383 aa  79.3  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  22.15 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  23.28 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2144  cysteine desulfurase IscS  24.26 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124025 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1592  Cysteine desulfurase  24.31 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  24.26 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  23.77 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  25.51 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  22.65 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  24.58 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  21.48 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  21.74 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27201  NifS-like aminotransferase class-V  25.68 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  22.92 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  22.11 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  22.45 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  22.59 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  23.08 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  23.79 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  21.14 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1696  cysteine desulfurase  24.82 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  22.92 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  22.92 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  22.92 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  22.92 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  22.33 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  23 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  22.92 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  22.92 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  25.68 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  22.92 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  22.92 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  22.92 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  24.09 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  24.5 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  22.22 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0289  aminotransferase, class V  21.59 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  22.92 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  22.67 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  22.67 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  23.55 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  22.22 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  22.67 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  22.67 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  26.67 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  22.67 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  26.36 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  21.9 
 
 		 407 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  23.5 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  23.53 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  23.53 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2990  aminotransferase, class V  25.1 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.46909  normal  0.329758 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  22.82 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1841  cysteine sulfinate desulfinase, NifS-like  22.56 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131774  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  23.7 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2092  aminotransferase, class V  25.78 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.935088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3207  Cysteine desulfurase  24.92 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  22.44 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  25.56 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  22.88 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  21.82 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  22.61 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  20 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  22.22 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  22.22 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  29.85 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  23.15 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  22.88 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  21.71 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2532  cysteine desulfurase  22.02 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  22.22 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  21.71 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  20 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  22.22 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  21.71 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  22 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  22.89 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  24.48 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  23.08 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34119  precursor of desulfurase cysteine desulfurase IscS  23.03 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  24.05 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  24.58 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02451  NifS-like aminotransferase class-V  23.05 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2368  aminotransferase, class V  25.1 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0313381  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1538  NifS-like aminotransferase class-V  23.05 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  21.57 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  22.18 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1737  homocysteine desulfhydrase  21.43 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.956175  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  23.73 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2004  aminotransferase, class V  25.1 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0411095  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  22.3 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  24.21 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  25.83 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2115  aminotransferase class V  25.87 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.903448  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  22.61 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>