More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13089 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13089  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  339  8e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00514635  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  61.76 
 
 
272 aa  132  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.34 
 
 
289 aa  85.5  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  41.9 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  40.54 
 
 
351 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  34.68 
 
 
293 aa  81.3  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  40.54 
 
 
291 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  40.54 
 
 
291 aa  80.9  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  40 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  40.46 
 
 
295 aa  77.4  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  39.8 
 
 
294 aa  77  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  35.83 
 
 
288 aa  71.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  39.81 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.75 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  40.2 
 
 
274 aa  67.4  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  40.4 
 
 
282 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  35.45 
 
 
307 aa  64.7  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  42.86 
 
 
283 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  40.21 
 
 
282 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  42.86 
 
 
283 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  40.21 
 
 
282 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  42.86 
 
 
283 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  40.21 
 
 
282 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  36.7 
 
 
289 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2634  luciferase family protein  34.74 
 
 
290 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.112704 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  27.33 
 
 
305 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  31.82 
 
 
298 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  33.59 
 
 
299 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  41.67 
 
 
278 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  31.37 
 
 
290 aa  62.4  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  38.89 
 
 
311 aa  61.6  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  33.1 
 
 
339 aa  60.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
329 aa  60.8  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  39.39 
 
 
301 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  40.37 
 
 
282 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  31.93 
 
 
315 aa  60.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  34.86 
 
 
288 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  37.19 
 
 
276 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  34.74 
 
 
353 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  36.36 
 
 
274 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  35.71 
 
 
322 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  55.56 
 
 
278 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  34.69 
 
 
285 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  35.64 
 
 
319 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  33.63 
 
 
292 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  28.47 
 
 
293 aa  57.4  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  33 
 
 
334 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  34.69 
 
 
281 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  36.73 
 
 
291 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  31.37 
 
 
341 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  36.36 
 
 
290 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4078  luciferase family protein  44.44 
 
 
303 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  35.83 
 
 
322 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  29.59 
 
 
293 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  29.59 
 
 
293 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  33.67 
 
 
285 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  29.59 
 
 
293 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  35.09 
 
 
327 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  35.09 
 
 
327 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  34.26 
 
 
288 aa  54.7  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  37.17 
 
 
342 aa  54.7  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  48.21 
 
 
282 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  46.43 
 
 
308 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  46.43 
 
 
308 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5018  luciferase-like protein  40 
 
 
283 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.915726  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  35.09 
 
 
342 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  35.29 
 
 
313 aa  53.9  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  33.67 
 
 
316 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  30.84 
 
 
341 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  36.56 
 
 
286 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  47.27 
 
 
308 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  31.82 
 
 
289 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  33.03 
 
 
286 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  35.71 
 
 
306 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.83 
 
 
273 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  55.32 
 
 
352 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  33 
 
 
344 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  32.65 
 
 
284 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  33 
 
 
344 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  33.03 
 
 
286 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  34.26 
 
 
306 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  33.03 
 
 
286 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  30.36 
 
 
311 aa  52.4  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  35.71 
 
 
341 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  33.01 
 
 
365 aa  52  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  48.15 
 
 
314 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  31.82 
 
 
333 aa  51.6  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  40.23 
 
 
346 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  35.54 
 
 
287 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  37.39 
 
 
274 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  45.9 
 
 
543 aa  51.6  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.84 
 
 
277 aa  51.6  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.06 
 
 
293 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  28.57 
 
 
337 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  43.4 
 
 
309 aa  51.2  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  38.95 
 
 
339 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  32.46 
 
 
327 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  37.89 
 
 
339 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  30.63 
 
 
333 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5311  luciferase-like protein  35 
 
 
283 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>