More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0669 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  52.13 
 
 		 288 aa  298  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  51.25 
 
 		 285 aa  297  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  46.98 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  49.27 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  47.99 
 
 		 289 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  47.48 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  46.04 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  47.45 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  47.14 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  47.08 
 
 		 295 aa  256  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  45.49 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  45.49 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  45.85 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  45.49 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  45.49 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  45.49 
 
 		 290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  45.49 
 
 		 290 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  45.49 
 
 		 290 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  45.49 
 
 		 290 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  45.49 
 
 		 290 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  45.85 
 
 		 290 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  44.25 
 
 		 288 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  44.04 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  42.34 
 
 		 287 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  43.59 
 
 		 285 aa  225  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  43.59 
 
 		 285 aa  225  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  37.91 
 
 		 299 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  40.66 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  38.63 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  40.88 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  40.21 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  37.63 
 
 		 304 aa  205  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1978  putative agmatinase  48.36 
 
 		 250 aa  205  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000215726  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  37.37 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  42.48 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  37.23 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  37.59 
 
 		 282 aa  201  8e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  40 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  34.88 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  35.23 
 
 		 293 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  34.98 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  33.45 
 
 		 294 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  37.23 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  37.36 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  34.56 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  35.87 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  34.64 
 
 		 319 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  34.19 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  34.64 
 
 		 319 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  34.19 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  34.19 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  34.19 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  34.19 
 
 		 316 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  35.82 
 
 		 329 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  34.63 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  34.28 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  34.3 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  33.92 
 
 		 318 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  36.8 
 
 		 327 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  34.15 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  33.92 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  34.43 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  33.57 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  32.99 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  34.16 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  34.16 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  33.45 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  33.57 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  34.07 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  33.57 
 
 		 342 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  33.81 
 
 		 318 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  33.57 
 
 		 321 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  33.82 
 
 		 306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  33.33 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2212  agmatinase  36.09 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000352659 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  34.31 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  34.78 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  33.21 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  34.07 
 
 		 318 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  33.57 
 
 		 330 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  35.9 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  33.69 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  31.87 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  32.72 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  34.07 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  33.09 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  35.96 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  32.01 
 
 		 319 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  38.32 
 
 		 311 aa  162  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  35.32 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  33.45 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  35.56 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  35.58 
 
 		 316 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  34.96 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  34.72 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  35.19 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  31.87 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  33.82 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  34.3 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>